【摘 要】
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我们选择豌豆根瘤菌的nodA-nodD启动子作为研究对象来探讨NodD操纵子的可诱导正激活分子机制.通过研究,我们提出了初步的NodD操纵子激活模型:第一,四聚体是NodD蛋白的功能单
【机 构】
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中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所
【出 处】
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中国科学院上海生物化学和细胞生物学研究所 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所 中国科学院上海生命科学
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我们选择豌豆根瘤菌的nodA-nodD启动子作为研究对象来探讨NodD操纵子的可诱导正激活分子机制.通过研究,我们提出了初步的NodD操纵子激活模型:第一,四聚体是NodD蛋白的功能单位,它通过铆钉两个串联的相对独立的DNA靶位点结合被诱导的启动子;第二,小分子配基的结合是改变NodD四聚体的构象而不是引发不同形式的寡聚体,在我们的模型中,NodD四聚体缩小其V形主体的弯折角,进而缩短其DNA结合功能域的间距;第三,小分子信号的诱导并没有改变NodD的DNA结合域和其DNA靶位点的相互作用,NodD的构象改变由蛋白质经其双铆钉位点传递给DNA;第四,只有诱导状态的NodD激发的DNA构象才能有效地使RNA聚合酶形成转录开放复合物;第五,不排除NodD与RNA聚合酶可能有直接的相互接触位点,不排除NodD构象的改变可能直接有利于RNA聚合酶形成转录开放复合物,但是我们认为NodD构象改变本身不是充当转录激活开关的决定因素.另外,该论文中叙述了对豌豆根瘤菌DNA结合蛋白Hurl和与铁离子吸收代谢有关的Sigma因子RpoI蛋白的部分研究工作.
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