目前合同管理已经成为工程建设项目管理的核心内容，同时工程合同不完备性已经成为一种常态，这种不完备性是导致合同争端的主要原因，所以对工程合同不完备性进行补偿是提高工程合同执行效率和避免工程合同争端、保证建设项目顺利完成的必然选择。因此，大量学者对如何设计合理而且有效的工程合同不完备性的补偿机制进行研究，使其成为目前研究的热点课题，而工程合同不完备性形成机理的研究是对不完备工程合同进行更有针对性分析的关键，可以为不完备合同的补偿机制的建立提供确切的依据和指导，在此基础上设计的补偿机制才能够实现有效针对性的目标。本文在对工程合同不完备性成因分析，以及开发工程合同不完备性测量量表的基础上，构建了工程合同不完备性形成机理的模型，并且提出了相关的研究假设，在北京、天津、山东以及河北等地开展了问卷调查，一共回收160份有效问卷。在此基础上，对各个测量量表的信度和效度进行了检验，并且采用结构方程模型对各个研究假设进行了检验。研究结果表明：①有限理性对工程合同不完备性具有直接的正向影响，而且有限理性对工程合同不完备性三个维度的影响作用有所差异，有限理性对合同条款构成有缺失具有直接的正向作用，有限理性对合同条款描述有歧义以及合同条款描述不完整有直接的正向影响，但是影响作用比较小；②不完全信息对工程合同不完备性具有直接的正向影响，而且不完全信息对工程合同不完备性三个维度的影响作用有所差异，不完全信息对合同条款描述有歧义具有直接的正向作用，不完全信息对合同条款构成有缺失以及合同条款描述不完整有直接的正向影响，但是影响作用比较小；③交易成本对工程合同不完备性具有直接的正向影响，而且交易成本对工程合同不完备性三个维度的影响作用有所差异，交易成本对合同条款描述不完整具有直接的正向作用，交易成本对合同条款构成有缺失以及合同条款描述有歧义有直接的正向影响，但是影响作用比较小。本文将有限理性、不完全信息、交易成本作为工程合同不完备性的前置影响因素，研究了这三个因素对工程合同不完备性的影响，揭示了工程合同不完备性的形成机理。另外，还对有限理性、不完全信息以及交易成本与工程合同不完备性的关系进行了论证，可以为不完备工程合同的补偿机制的建立提供指导，以提高合同执行的绩效，保证工程建设的顺利进行。