我国农村经济在集体所有的产权制度安排下不断发展,农村集体经济在农村发展需求和国家的推动之下不断被探索实践。农村集体经济股份合作制是一种典型的农村集体经济实现形式典型的实现形式,其发展过程中的形成的各种组织模式以及运行过程中的合作机制具有一定的研究意义。因此本文基于现有农村集体经济股份合作组织模式,结合演化博弈的分析方法,首先对目前农村集体经济股份合作组织模式进行总结,然后阐述包括分析股份合作组织和农户之间的成本收益分配机制以及加入地方政府主体的监督惩罚机制在内的农村集体经济股份合作组织的合作机制。本文的主要研究如下:首先,本文先明晰研究对象相关概念的具体涵义,包括农村集体经济、农村集体经济的实现形式、股份合作制和农村股份合作组织,并梳理和介绍了所涉及的部分理论,包括产权理论、制度变迁理论、交易费用理论、农业规模经济理论和委托代理理论,特别对演化博弈这一重要理论进行了阐述。其次,归纳总结三种不同的农村集体经济股份合作组织模式,分别是农户自主经营型股份合作组织、社区经营型股份合作组织和联合经营型股份合作组织,引用实例对不同股份合作组织进行比较分析,并分别从参与主体的自身内在因素和环境外在因素的角度对不同农村集体经济股份合作组织模式的选择依据进行阐述。最后,采用演进博弈的分析模型,对农村集体经济股份合作组织的合作机制进行了研究。一方面分析了农户和股份合作组织之间的利益分配机制,另一方面阐述了加入监督惩罚机制后博弈主体之间的博弈关系。分析结果表明,博弈方股份合作的总成本、超额收益、成本分担系数与收益分配比例、背叛收益、单边股份合作行为的收益、惩罚奖励金的变化会影响演化博弈的结果,同时基于各影响因素对农村集体经济股份合作组织进行比较分析,通过数据模拟和实例分析进一步解释和证明了研究结果的正确性,并给出了相应的实际建议和结论。