本文根据云南省1999年至2011年的农村水利设施投资、农村固定资产投资和农业产出等方面对云南省的农村水利设施投资的现状进行分析，然后在道格拉斯生产函数的基础上建立关于农村水利投资与农业产出的模型，运用云南省、全国和西部各地区的数据进行回归，对回归结果进行对比分析，得出云南省农村水利设施投资对其农业产出的具体影响及其存在的问题。此后对云南省农村水利设施投资主体及供求动态过程进行分析，总结得出影响各投资主体投资因素，结合已有的关于农村水利投资的激励机制模型，设计调查问卷，对影响云南省农村水利设施各投资主体投资的各激励因子的权重进行计算，分析得出对农村水利设施投资重要的激励因子，以此为基础给出政策建议。通过对云南省农村水利设施投资现状和农村水利设施投资与农业产出之间的具体关系的分析研究得出：云南省的农村水利设施年投资额较少，农村水利设施存量水平较低，两者均低于全国农村水利设施投资的平均水平和其他资产的水平；云南省农村水利设施的缺乏限制了其农业产出的增长。针对云南省农村水利设施投资不足的问题，运用农村水利设施投资激励相容模型，根据调研数据分析得出税收优惠与政策扶持、产权与经营方式、社会效用、定价方式与成本形式和财政补贴与信贷支持是最重要的五个激励因子。本文最后提出了应优化对农村水利设施投资的税收，加强对农村水利设施建设的政策扶持；明确农村水利设施投资主体的产权，并确立合理的经营方式；增加农村水利设施的财政补贴，加强信贷支持；增强区域合作，鼓励多元化主体投资；完善农村水利设施方面的法律法规，鼓励农户参与等方面来促进农村水利设施投资的增加。