基于多重连接探针扩增技术(MLPA)高灵敏度检测多重microRNA

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MicroRNA(miRNA)是一类内源性的非编码小分子RNA,通过与目标信使RNA(mRNA)结合形成基因沉默复合物(RISC)调控基因的表达。MiRNA在细胞代谢、分化、免疫反应和肿瘤发生等生物过程中有重要的调控作用。许多研究表明,癌症组织中miRNA的表达异常通常与多种miRNA(一般是2-15个)有关。因此,建立一种灵敏度高、精密度好、可以同时检测多种miRNA的方法不仅在癌症的早期临床诊断和治疗方面有重要作用,对于深入了解肿瘤发生的机理也有重要的意义。本文建立了一种基于多重连接探针扩增技术(MLPA)高灵敏度检测多重miRNA的方法,使用RNA碱基修饰的DNA探针,以miRNA为模板,能够被T4RNAligase2高效连接。利用PCR对连接的探针扩增,毛细管电泳对PCR产物进行分离检测,可检测低至0.2fmol/L的let-7a,并且能区分miRNA序列中单个碱基的错配。我们随机选取了5种序列不相关的miRNA:mir-92a、mir-31、mir-143、mir-145和let-7a。该5种miRNA以不同长度的DNA探针进行编码,可在同一管PCR扩增反应中同时得到高灵敏度检测。将此方法进一步应用于A549细胞系(人类肺腺癌细胞株)中total RNA的miRNA检测,可以同时检测出5种目标miRNA,表明此方法能用于实际样品分析。因此,基于MLPA多重检测miRNA技术提供了一种高灵敏度、高通量检测多种miRNA的方法。
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