基于稀疏表达的肿瘤分类方法研究

来源 :湖南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:callingme
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近几十年来,肿瘤疾病已经成为人类面临的最难治愈的疾病之一,严重的危害着人类的生命健康,到目前为止尚未找到有效的治疗方法。想要治疗肿瘤疾病,首先要进行正确的肿瘤亚型诊断,用生物信息学中的术语来说就是肿瘤分类。在此之前,传统的肿瘤分类方法主要是通过显微镜检查病理组织的方式来进行分类,这种方法在普通的肿瘤诊断中效果表现不错,但是如果有两种甚至多种肿瘤亚型在组织形态上非常相似,而这在实际情况中也是很常见的,那么此时传统的组织病理学检测方法的效果就不那么令人满意了。因此,本文针对可应用到临床的肿瘤亚型分类方法进行了研究,主要包含以下两方面内容:(1)针对现有的基于稀疏表达的肿瘤分类方法在最终的分类决策方面的不足,本文提出了一种新的结合字典对样本的重建能力与稀疏编码系数判别能力的新模型,该模型在理论上可以进一步提高分类精度。利用字典可以对测试样本进行近似表达,在已有的基于字典学习的分类方法的最后也常常使用样本的重建残差作为最终的分类决策;稀疏编码系数作为另一个约束项,使得在对测试样本进行近似表达时,使用到的字典的“原子”尽量少但却完全足够。该模型在六个常用肿瘤数据集上进行的一系列实验表明,本文提出的新方法在大部分情况下均提高了分类准确度。(2)考虑到D-KSVD方法在数据的分类及特征识别方面表现出了很好的性能,本文考虑将其应用到基于基因表达谱数据的肿瘤分类领域。该方法的本质就是在K-SVD方法的基础上引入了线性回归作为惩罚项,以求进一步提高分类准确度。D-KSVD同样综合考虑了字典对测试样本的重建能力与编码系数的稀疏约束能力,同时在K-SVD的基础上引入了分类误差项,考虑到了字典构造过程中字典的判别能力。在六个常用肿瘤数据集上对该方法在肿瘤分类领域的性能表现进行了验证,结果表明其确有良好的分类性能。
其他文献
目的:基底细胞癌发病率有着明显的地区、人种、肤色差异,且有多项研究表明其与长期日晒、摄入或接触过多砷剂、放疗、化疗、烧伤、局部慢性伤口、遗传因素、免疫抑制剂等有关。内蒙古包头地区为紫外线照射强度较强及照射时间较长的地区,包头亦为工业城市,且肿瘤的发病率及皮肤病发病率逐年增加,上述因素均与基底细胞癌发病因素相关。探讨近10年基底细胞癌发病率在包头地区的趋势,利用统计学分析方法,分析包头地区基底细胞癌
采用样方法和样点法于2011年和2012年3-10月对呼兰河湿地鸟类群落结构进行了研究。黑龙江呼兰河口湿地内共分布有鸟类14目38科143种,鸟类群落的基本组成符合东北鸟类分布和湿
随着互联网的发展和普及,人们喜欢在各大网络社交平台上分享自己的观点和态度,习惯于在网络购物平台上分享消费体验、购物心得。其中,旅游网站的用户评论中反映了游客对于景
随着数据模态多样化,高光谱数据作为具有图谱合一优势的一类遥感数据受到了广泛关注,该数据能够同时获取观测对象的空间维度和光谱维度信息,并多尺度、多维度的描述被观测对
英语作文可以直接具象的显示初中生学习英文过程中已具备的核心素养。教师若想培养学生学习英文的良好品格和必备能力,即核心素养,就必须秉承协调发展的教学理念,通过英语作
在当代社会,教学过程中更加注重全面发展,而核心素养则成为学生适应社会发展需要的关键,其主要指的是学生在学习过程中的成绩与能力,格外注重学生的自主发展与创新实践,而在
癌症已成为威胁人类生命健康最重要的疾病之一。肿瘤诊断是医学领域的一大难题。DNA微阵列技术的出现使得肿瘤在基因表达水平上的研究得以实现,这为肿瘤分类提供了另外一种重
工程量清单计价方法,是目前国际建筑行业普遍采用的计价方式,本篇介绍了工程量清单计价方法在控制工程造价,降低工程成本,完善市场竞争机制中所起的作用。
行政协议受案范围是行政协议纠纷案件司法解决机制的关键问题,也是人民法院受理案件的前置条件,直接反映了法院对行政行为的审查范围和监督强度。受行政协议方式的广泛运用和行政协议纠纷司法解决实践的推动,行政协议受案范围处于不断拓展之中。行政协议受案范围的变动反映了行政诉讼受案范围的一般规律,也彰显了行政权、司法权与公民之间的紧张关系,构筑一个合理的、协调的行政协议受案范围,既有利于推进行政协议方式的行政运
随着新课程改革的进行,教师教育的概念已从传统的以教师为中心的教学理念逐渐转变为以学生为中心的教学方法。传统的教学方法主要以教师为主,教师主要采用时间加练习的教学方