紫花苜蓿(简称苜蓿)是我国和世界种植面积最大最重要的豆科牧草。随着苜蓿种植面积和利用年限的不断增加,根腐病成为了限制苜蓿生产的主要因素之一,严重影响苜蓿的产量和品质。揭示苜蓿根腐病发生的土壤微生态机制,对苜蓿的根腐病的防治以及促进苜蓿产业的可持续性发展具有重要的理论和实践意义。本研究通过高通量测序技术对我国西北紫花苜蓿根腐病发生区真菌结构及其多样性进行了分析,并结合土壤特性、气候因素、地理距离因素和海拔因素,初步探寻影响土壤真菌多样性的关键驱动因素。主要研究结果如下:(1)通过环境因素与苜蓿根腐病发病程度的相关性分析,发现苜蓿根腐病发病程度与土壤含水量、磷含量、钾含量以及种植年限相关。其中钾含量可以降低根腐病的发病程度,土壤含水量和种植年限的增加会促进根腐病进一步发病。(2)通过真菌多样性的研究发现,门水平上的优势类群为子囊菌门(Ascomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)担子菌门(Basidiomycota)和壶菌门(Chytridiomycota);属水平上的优势类群(相对丰度>1%)为被孢霉属(Mortierella)、毛壳属(Chaetomium)、芽枝霉属(Cladosporium)、链格孢属(Alternaria)、赤霉菌属(Gibberella)、镰刀菌属(Fusarium)、青霉菌属(Penicillium)、轮枝孢属(Verticillium)、四枝孢属(Tetracladium)、曲霉属(Aspergillus)。(3)进一步分析土壤真菌多样性与环境因素,地理距离因素和海拔因素的关系发现:土壤性质中的土壤含水量是土壤真菌多样性的主要驱动因素,钾含量和土壤机械组成也对土壤真菌多样性有显著影响。本研究还证明气候因素,地理距离因素和海拔因素也是土壤真菌多样性的重要预测因素。其中年平均降水量和海拔是土壤真菌多样性最佳预测因素。(4)为了解释微生物生物地理格局现象,本研究探寻了环境因素和地理距离因素对土壤真菌多样性相对重要性。环境因素和地理距离因素分别解释了真菌群落变异的25.3%和1%。因此,相比较于地理距离因素,本研究认为在区域尺度内环境因素是驱动土壤真菌多样性的更重要的因子。这也表明在区域尺度内扩散限制可能不如当代环境条件构建真菌群落的重要性。