氟虫腈作用下斑马鱼miR-216和miR-499对cyb561d2调控作用的研究

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miRNA主要通过与靶mRNA的3’端结合降解或抑制靶基因的翻译,从而对靶基因进行转录后调控。由于miRNA识别靶基因并不是一一对应的关系,存在着几个不同的miRNA联合调控同一个靶基因的可能,而一个miRNA也可能调控多个靶基因。我们之前研究发现,斑马鱼中cyb561d2是miR-155的靶基因,并且在氟虫腈(5-氨基-1-[2,6-二氯4-(三氟甲基)苯基]-4-[(三氟甲基)亚磺酰基]-1H-吡唑-3-腈)的胁迫下cyb561d2的表达受miR-155的调控。在本实验中,我们通过Microcosm Targets预测发现cyb561d2有可能是miR-194a、miR-216b、miR-429和miR-499共同的靶基因,通过实验验证了这4个miRNAs分别与cyb561d2之间的关系。我们评估了氟虫腈暴露下斑马鱼中这4个miRNAs的表达,研究4种miRNAs能否调控cyb561d2的表达,结果发现随着氟虫腈处理浓度的升高,斑马鱼中miR-216b和miR-499的表达量明显下调,而miR-194a与miR-429的表达量却没有明显变化。  为了解释氟虫腈处理后miRNA表达的变化,同时验证生物信息学预测的结果。我们通过重叠延伸PCR将cyb561d23’-UTR中miR-194a、miR-216b、miR-429和miR-499推定结合位点分别敲除,成功构建了4个重组海肾荧光素酶载体,分别命名为pRL/S-K.O-194a、pRL/S-K.O-216b、pRL/S-K.O-429、pRL/S-K.O-499。通过双荧光素酶报告基因法验证了斑马鱼cyb561d23’-UTR中存在miR-216b和miR-499的结合位点,而并不存在miR-194a和miR-429的直接结合位点。  我们通过对ZF4细胞转染miR-499 mimic后,检测细胞中cyb561d2的表达量,发现cyb561d2在mRNA水平及蛋白水平都显著下调,而转染miR-499 inhibitor后,cyb561d2的mRNA水平及蛋白水平则显著上调,同样的对ZF4细胞转染miR-216b mimic后,cyb561d2的表达量下调,转染miR-216b inhibitor后, cyb561d2的表达量则显著上调,然而对ZF4转染miR-194a或miR-429 mimic,细胞中cyb561d2 mRNA的表达并没有发生明显的变化。综上所述,我们发现cyb561d2是miR-216b和miR-499的靶基因,而不是miR-194a和miR-429的靶基因,而在氟虫腈暴露下miR-216b与miR-499的变化表明其可以作为暴露于氟虫腈环境的生物标志物。
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