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目的:建立小细胞肺癌和大细胞肺癌蛋白质表达谱,为全面研究肺癌蛋白质水平的变化提供重要信息,并在此基础上建立以HUP-ML为基础的2D-PAGE数据存储、查询系统,有效组织和保存相关实验数据,为建立更完善的、复合HUPO标准的蛋白质组数据库进行初步尝试.研究结果:应用双向凝胶电泳技术获得了分辨率较高、重复性较好的小细胞肺癌细胞系NCI-H446及大细胞肺癌细胞系NCI-H460的蛋白质双向凝胶图谱.应用质谱技术鉴定了两株细胞共同表达的56个蛋白质点.通过查询SWISS-PROT数据库获得其相应的功能注释.应用PHP、XML编写了2D-PAGE相关数据查询软件、构建了基于HUP-ML的2D-PAGE数据存储查询系统.结论:建立了两株细胞系的双向凝胶参考图谱.初步构建了其蛋白质表达谱.建立了复合HUP-ML的2D-PAGE实验数据的web查询系统.