四种猪病病原的液相芯片检测方法的建立

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猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪细小病毒(PPV)以及猪圆环病毒2型(PCV2)等是导致猪繁殖与呼吸障碍疾病的主要病原。PRRSV和PCV2的感染还造成猪的免疫抑制,导致猪体免疫力下降,以至于对其他疾病的易感性增高,易引发其他疾病的继发感染。兽医临床上这四种病原感染的妊娠母猪都以产死胎、木乃伊胎、畸型胎及弱仔等为共性症状,临床诊断不容易区分,给疾病的及时治疗带来不便,严重影响养猪业健康发展。下载GenBank中公布的PPV结构蛋白VP2基因、PRRSV的ORF1开放性阅读框序列、PCV2和CSFV的全基因序列各20余条,分别用DNAman V6进行多序列比对分析,筛选出保守区后将其导入Beacon Designer7.9设计出PPV、PCV2、PRRSV、CSFV的特异性探针引物组合及探针反向互补序列。将探针与微球偶联,下游引物和探针互补序列分别标记生物素,采用不对称性多重PCR/RT-PCR扩增靶序列,再把PCR特异性和敏感性产物与验证偶联成功的微球寡核苷酸探针杂交,杂交结果用液相芯片系统检测分析;应用建立的液相芯片方法对36头份临床样品进行检测,并用PCR/RT-PCR检测结果与xMAP检测结果做比较,进行结果的一致性评估分析。通过对退火杂交温度等反应条件优化,建立了PPV、PCV2、PRRSV、CSFV的四重液相芯片检测方法,各引物探针组合特异性好,与其他病毒没有交叉反应,并可敏感检测四种病毒核酸的下限分别达6.11×10~4copies/μL、5.17×10~4copies/μL、3.53×10~4copies/μL、4.26×10~5copies/μL;用建立的PPV、PCV2、PRRSV、CSFV四重液相芯片检测方法对临床36头份样品检测,并用普通PCR/RT-PCR方法对xMAP检测样品进行重复性检测,结果表明:两种方法取得一致性检测结果。研究成功构建了同时检测PPV、PCV2、PRRSV、CSFV的四重液相芯片快速检测方法,为猪病的快速高通量鉴别诊断搭建新技术平台,也为液相芯片技术在动物多病毒快速高通量检测、鉴别诊断等应用方面奠定了基础。
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