当今世界,技术和知识密集型产业对推动经济的长远发展、产业结构的升级和社会的和谐稳定有着深远的影响,在“十三五”时期,必须树立落实“创新、协调、绿色、开放、共享”的发展理念,而高新技术产业作为一种技术密集型和知识密集型产业,迎合了这一理念,是我国传统的粗放型产业向创新型和资源节约型产业过度的一个重要阶段,因此高新技术产业的发展关系到安徽省经济结构的调整、产业升级,对推动我省经济结构转型升级和经济发展起到重大作用,而高新技术产业创新效率是高新技术产业竞争力提高的关键。本文首先梳理了高新技术产业及创新效率的相关理论,对安徽省高新技术产业的现状进行总结概括,通过构建合理的创新投入和产出指标体系,运用因子分析和DEA三阶段模型对安徽省高新技术产业的创新效率进行比较分析。主要比较分析了安徽省与东部11个省市高新技术产业的创新效率、安徽省五大高新技术行业的创新效率以及安徽省与东部11个省市电子及通信设备制造业的创新效率。研究发现:2011-2015年安徽省高新技术产业的综合技术创新效率均值不高,与东部11各省市的效率均值有差异,要远低于北京、天津、上海、江苏、浙江、福建、山东、广东等地,但高于河北、辽宁、山东、海南等地;五大高新技术行业的创新效率水平参差不齐,电子及通信设备制造业综合技术效率较高,但与东部相比仍然存在一定的差距;整体上规模效率要普遍低于纯技术效率,规模效率的下降拉低了综合技术效率的水平;在环境因素上,外资的投入和政府的支持有利于安徽省高新技术产业的发展,企业平均规模并非越大越好,小企业更加充分的发挥资源的利用效率。根据研究的结果分别从国际层面、政府角度、企业规模角度,行业内部等给出了相关的意见建议。文章的研究内容主要包括六个部分:第一章为绪论部分,主要从研究的背景与选题的意义、国内外对高新技术产业的相关文献研究、文章研究的目标和研究方法以及可能的创新点进行阐述;第二章从相关概念和理论基础着手,阐述了高新技术产业的概念、技术创新的相关理论、创新效率的相关理论以及因子分析方法和DEA三阶段模型等;第三章从安徽省高新技术产业的总体发展趋势、研发投入和创新产出以及五大行业的发展状况进行整理分析;第四章对安徽省高新技术产业创新效率指标的选取原则、选取方法和指标体系构建展开了论述;第五章基于因子分析和DEA三阶段模型对安徽省高新技术产业的创新效率进行实证分析,根据结果比较安徽省与东部11个省市高新技术产业及行业创新效率的差异性情况。第六章总结,根据实证研究的结果进行概括,提出有针对性的建议,并指出文章的研究不足和未来的研究方向。