藏传佛教的发展过程中共有两次重要的整顿，一为阿底峡尊者在后弘期佛教开始渐渐兴起之时所进行的教风学风之整顿，其二便是宗喀巴大师所进行的宗教整顿。宗喀巴大师的宗教整顿发生于14世纪后期，当时西藏佛教各教派戒律废弛，僧人腐化堕落，出现了“颓废萎靡之相”。宗喀巴大师对此深生不忍，遂开始了对藏传佛教的整顿。重整佛教戒律；提倡先显后密、显密并重的学习制度，并强调“三藏不可偏废，三学亦须全修”，重新确立了藏传佛教“闻、思、修”三学并重的学风；规范了寺院组织机构及学经制度，僧人的修习有了次第有序、规范、完善的组织安排，保证了其修习的系统性和完整性。清净的戒律为一切菩萨行之基础，戒律对于佛教教法有着重要的基础性，因而重整戒规也因此成为宗教整顿的重要方面，其戒学思想也因此显得十分重要。宗喀巴大师以菩萨戒的思想统摄三乘戒律，并将其融入“三士道”次第的修证系统之中，统一大小乘戒律。本文将以历史和思想相结合的方法，对宗喀巴的宗教整顿做出介绍，并阐述宗喀巴大师的戒学思想。