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以皖西白鹅为父本与四川白鹅杂交，测定两个亲本群体和杂种一代群体鹅的胴体和羽绒性状40个，利用因子分析提炼并构建公共因子12个；依据公共因子利用聚类分析将所有个体分成6个组并进行效应估计。通过比较基因组学和现代分子生物学技术，克隆了鹅重要经济性状3个候选基因：脂蛋白脂酶基因（LPL）、促黑激素皮质素受体-4基因（MC4R）和肌细胞生成素基因（MyoG）；利用PCR-SSCP检测LPL基因的SNP，利用PCR-RFLP与序列测定相结合检测MC4R和MyoG基因在HinfⅠ、EarⅠ、PstⅠ和PvuⅡ酶切位点的SNP。建立包含个体的组效应和SNP基因型效应在内的效应分析模型，估计各基因型对胴体和羽绒性状的效应、基因型对性状的贡献率、以及基因对性状的主效应指数。结果表明：1．杂种一代的胴体性状和肉质性状没有明显的杂种优势，说明群体中基因非加性效应不明显；而羽绒性状却存在明显的基因非加性效应，其中绒比重和绒湿润比重的杂种优势率分别为-10.1685％和4.7160％。2．克隆并测定了LPL、MC4R和MyoG基因的序列，登录于GenBank，收录号分别为DQ105795～105799、DQ482582和DQ294735。三个基因与鸡的同源性分别为92.4％、95.3％和91.9％。3检测发现杂种一代鹅LPL基因5个外显子存在SNP，组合成8种SNP基因型。不同基因型对胴体和羽绒性状遗传效应的分析结果表明，S1是减小腿肌纤维直径的优势基因型，S2是降低产脂力的优势基因型，S4是降低腿肌粗脂肪的优势基因型，S5是提高腿肌重、胸腿肌率、千朵重和减小腿肌纤维直径的优势基因型，S7是降低绒湿润比重的优势基因型，S8是提高腿肌粗脂肪的优势基因型。从基因的主效应指数来看，LPL基因可以作为腿肌脂肪、绒湿润比重、全净膛率和半净膛率的主效基因，这些性状的表型变异中有11％以上是来自LPL基因SNP的联合方差。4检测发现杂种一代鹅MC4R基因有3个HinfⅠ酶切位点，酶切得到一对等位基因H和h，等位基因h是酶切位点373bp处核苷酸G→A替换（用G373A表示，下同）和T915C替换所致，其中G373A导致MC4R氨基酸Asp125Asn替换。核苷酸替换对胴体和羽绒性状遗传效应的分析结果表明，Hh能显著提高产脂力和脂肪酸品质，而HH型则能显著提高鹅的产肉力。5检测发现杂种一代鹅MyoG基因在EarⅠ和HinfⅠ酶切位点存在SNP，EarⅠ酶切得到一对等位基因E和P，等位基因e是G276A和G288T发生核苷酸替换所致，其中G288T导致MyoG氨基酸Lys96Asn改变。HinfⅠ酶切得到一对等位基因H和h，等位基因h是A164T发生核苷酸替换所致，该替换导致MyoG氨基酸Asp55Val改变。核苷酸替换对胴体和羽绒性状遗传效应的分析结果表明，Eehh型是提高产肉性能的优势基因型，EEHH型是改善肉系水力的优势基因型，两个酶切位点SNP对羽绒性状没有显著的影响。比较MyoG基因的主效应指数表明，MyoG基因的EarⅠ和HinfⅠ酶切位点可以作为鹅肌肉失水率、腿肌粗脂肪、心脏率和肌胃率的主效应位点。