河西走廊盐碱土壤细菌16S rDNA克隆文库分析

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河西走廊存在大面积的原生盐碱土,由于人类活动而造成的次生盐碱土面积也在不断的扩大,生态环境极度脆弱,严重影响了该地区农业和经济的发展。开展该环境土壤中细菌种群结构多样性的研究,有利于揭示该环境中微生物的分布特征及微生物对盐碱环境的适应性机理,并对盐碱土壤的改良及生态环境恢复均有积极意义。  本文选取了河西走廊地区不同盐碱程度的5个样点,利用免培养方法,通过建立16S rDNA克隆文库和系统发育树来分析了河西走廊地区盐碱土壤的细菌种群结构及多样性。  结果显示,原生盐碱土、次生盐碱土和农田土三种不同类型的土壤中细菌种群结构的组成和丰度具有明显差异。原生盐碱土细菌共存在6大细菌类群,分别为:变形菌门(Proteobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria),其中Firmicutes和γ-proteobacteria为优势菌群,且还未被分类鉴定的菌较多,占8.09%。  三个次生盐碱土样品存在很大差异,γ-proteobacteria为其共同优势菌群,其中4号样品类群数最多,除了拥有原生盐碱土中所有的6大类群外还有疣微菌门(Verrucomicrobia)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)。而2号和3号分别只有5种和4种类群。还未被分类鉴定的菌均较多,平均为14%。  作为对照的农田土中存在3大细菌类群,分别为Proteobacteria、Firmicutes和Actinobacteria,其中Firmicutes为优势菌群,并且未知菌很少。  如 Marinobacter、Halomonas、Pseudomonas、Ectothiorhodospiraceae和Methylophaga等嗜盐菌普遍存在于本研究的盐碱土中。
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