随着世界一体化进程的加速,科学技术竞争已经日益成为国家间竞争的焦点,其中自主创新能力成为决定国家竞争力的关键性因素。自主创新能力不仅是国家竞争力的核心,也是企业生存和发展的关键。从发达国家的经济发展过程来看,产学研合作是企业技术创新的最主要途径之一,基于产学研合作创新,促进企业技术进步,是世界各国推动科技进步和经济发展的普遍经验。但是目前我国产学研合作水平较低,在合作中还存在较多的问题,尤其是在合作的各个环节和阶段都还存在阻碍合作顺利进行的障碍因素。尽管产学研合作创新的形式已经受到了产业界和学术界广泛的关注和重视,但是在实践中,合作过程中仍然呈现出各种问题。本文将在深入分析这些问题的基础上进一步基于系统论的思想来探讨影响产学研合作的关键性障碍因素。根据系统论的观点,本文将产学研合作分为三个层次,分别是:高等院校、科研院所和企业三个子系统的微观层次,三个子系统之间合作的中观层次,产学研合作大系统与外部环境的宏观层次。在这种分类的基础上,研究产学研合作中不同层次上的障碍性因素,讨论这些因素产生的原因和造成的影响。通过这些分析有针对性的对产学研合作提出的建设性的对策与建议,为我国产学研合作的进一步发展提供借鉴。