在研究复杂性科学的过程中，美国和欧洲提出了解决复杂性问题的两个重要理论:复杂适应性系统(CAS)理论和远离平衡态理论，我国科学家提出了开放的复杂巨系统理论。开放的复杂巨系统理论是建立在钱学森院士渊博学识、长期的科研、实践经历之上的，是我国科学史上的伟大贡献。钱学森院士结合自己的实践探索和现代信息网络技术蓬勃发展的背景，提出了开放的复杂巨系统的方法论:从定性到定量的综合集成法，综合集成思想正是理论上的抽象与升华。　　企业绿色指标系统是评价企业在经济、科技创新、环境、文化等方面是否环境友好、资源节约，是否绿色的有效辅助工具，对企业的快速、健康发展起着至关重要的作用。在现阶段，企业追求发展的同时，更需要关注发展所带来的负面效应，需要敢于承担社会责任，创建一个能帮助企业绿色发展的评价系统，提到了紧要关头。　　本文阐述了复杂性科学、综合集成研讨厅(HWME)的发展历程和具体内容，归纳出具体的研究成果;针对综合集成解决复杂问题的特性，结合综合集成研讨厅的研究情况，结果发现对综合集成的绿色企业评价系统的研究鲜为少见，于是提出了基于综合集成研讨厅的绿色企业评价系统指标评价流程，以及具体实现的系统的总体框架、研讨流程，并详细说明了设计流程、用到的编程技术、语言，最后实现了专家研讨、评价指标系统，分析了系统存在的不足，对系统提出了更高要求。