【摘 要】
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为了研究H7N9亚型禽流感病毒的生物特性和揭示禽流感病毒的变异规律,首先用改进的BP神经网络和遗传算法相结合对HA与NA蛋白进行分类研究,提出一种四参可调的双曲正切函数用于
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为了研究H7N9亚型禽流感病毒的生物特性和揭示禽流感病毒的变异规律,首先用改进的BP神经网络和遗传算法相结合对HA与NA蛋白进行分类研究,提出一种四参可调的双曲正切函数用于改进BP神经网络,改进后的均方误差比传统BP神经网络减少了3%,另外将改进的BP神经网络与遗传算法相结合,优化了网络的权值,均方误差也减少到原来的8%,大大提高了蛋白质分类的精度。之后我们用PredictProtein软件分析杭州H7N9亚型禽流感病毒KC853766的HA蛋白二级结构,无规则卷曲结构最有可能与抗体结合,再运用DNAStar和DNAMAN软件对HA蛋白进行B细胞抗原表位分析,发现有23个潜在的抗原表位。最后使用clustalx和mega5软件,对H5N1、H9N2、H7N7、H3N2、H7N9五种亚型禽流感HA基因的核苷酸序列进行比对和遗传进化分析,运用贝叶斯方法预测HA蛋白的正向选择位点,从构建的进化树来看,H7N9亚型禽流感病毒可能是在H7N7的基础上进化得到的,HA蛋白中存在31个正向选择位点,最可能发生变异的位点是754-756,其中211-213位点是B细胞抗原表位与正向选择位点的交集,推断这可能就是杭州H7N9禽流感病毒KC853766战斗力的核心位点,本研究为进一步确定HA蛋白的B细胞抗原表位和H7N9疫苗的设计提供了理论基础。
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