HeLa细胞传代过程中的基因表达变化

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HeLa细胞是增殖快并能无限增殖的宫颈癌细胞,具有可以连续传代不衰老致死的特点。然而,我们发现长期传代培养至100代后,HeLa细胞形态开始发生变化、细胞生长变慢。为了探究长期培养后HeLa细胞“永生”或衰老特征,本文从HeLa细胞35代(我们拿到的最年轻代细胞)开始,连续传代培养至125代,并每隔5代选取1代,共19个不同代HeLa细胞进行RNA-seq分析,相对35代细胞,得到18个不同代HeLa细胞转录组数据。分析发现:(1)随着细胞传代次数的增多,差异表达基因数也有不同程度的增加;(2)与35代HeLa细胞相比,18个不同代的HeLa细胞中与细胞衰老的基因如CCND3的表达有不同程度的上调;(3)与细胞信号转导和调节细胞途径的基因如ECEL1的表达有不同程度的下调;(4)KEGG富集分析发现差异表达基因富集的信号通路与细胞衰老相关,如NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路;对这些通路差异表达基因进行进一步分析发现MAPK信号通路IL1A、IL1B基因表达有上调,在95、105代细胞中表达上调最为明显;(5)与细胞基础代谢相关的通路如氧化磷酸化、核糖体通路的差异基因表达大多下调,核糖体如AC138811.2基因表达下调,在115、125代细胞中表达下调最为明显。综上所述,随着HeLa细胞连续传代次数的增多,维持细胞基本生命过程的细胞途径及基础代谢相关基因表达水平有降低;与细胞衰老有关基因表达有提升。结果说明随着连续传代次数的增多,HeLa细胞有一定衰老特征。
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