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东北粗皮蛙Rugosa emeljanovi为蛙科(Ranidae),粗皮蛙属(Rugosa)动物。在我国主要分布在黑龙江、吉林和辽宁。东北三省跨越了寒温带和中温带,属于温带季风气候,春夏秋冬四个季节差别很大。山水环绕、沃野千里是东北地区地面结构的基本特征,其东方和北方有鸭绿江、图们江、乌苏里江和黑龙江环绕,南方靠近黄海和渤海,只有西面边界为陆界。内侧是大兴安岭、小兴安岭和长白山系的高山和丘陵,在其中部是辽阔的松辽大平原和渤海凹陷。东北粗皮蛙主要栖息在水田、流水缓慢的河流和山间溪流及水渠岸边。本文通过对东北粗皮蛙29个样本的线粒体DNA控制区和细胞色素b基因的部分序列分析,探讨其遗传多样性和种群遗传结构。PCR扩增和测序结果,获得587bp的线粒体DNA控制区序列和895bp的细胞色素b基因序列。合并线粒体DNA序列分析,共定义14个单倍型,16个变异位点,单倍型多样性(H)为0.418,核苷酸多样性(π)为0.001,平均核苷酸差异数为0.667,表明东北粗皮蛙遗传多样性较低。分子变异分析(AMOVA)结果,种群内变异占全部遗传变异的98.13%,群体间没有遗传分化(FST=0.0187),也就是说遗传变异几乎全部来源于群体内个体间。因而应加强对东北粗皮蛙野生种群的保护,特别是栖息地的保护。从调查研究结果来看,其栖息地类型结构单一,多样性程度低,这可能是东北粗皮蛙种群遗传多样性低主要因素。将本研究测得东北粗皮蛙线粒体细胞色素b基因序列与韩国东北粗皮蛙的同源序列进行种群遗传学研究对比,韩国东北粗皮蛙可以分成2个分离的支系(A和B),A贯穿于整个韩国地域,B则集中于韩国东南的中部地区,而在韩国Tonghae种群中2个支系类型都有发现。A支系的6个种群Cytb序列差异为0~0.8%,B支系的4个种群为0~1.0%,但2个支系间的序列差异则达到5.4~6.6%,基于Kimura双参数的A与B支系遗传距离是6.7%。本研究中,线粒体Cytb基因部分序列分析,核苷酸多样性仅为0.001,平均核苷酸差异数为1.438,9个种群间的遗传距离为0~0.2%,低于韩国2个支系内种群间的变异水平。分子变异分析结果显示,东北粗皮蛙种群遗传变异几乎全部来源于群体内个体间,群体间没有遗传分化(FST=0.01868),明显低于韩国种群。