第一部分:隆突性皮肤纤维肉瘤:单中心254例患者临床病理及治疗分析 第二部分:基于TMT技术对隆突性皮肤纤维肉瘤的蛋白组学的初步探究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xjy1234
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景与目的:隆突性皮肤纤维肉瘤(Dermatofibrosarcoma Protuberans,DFSP)属于一种相对不常见的、低度恶性的软组织肉瘤,复发率及误诊率都很高,很少转移。有时DFSP可以发生纤维肉瘤样改变,形成纤维肉瘤样隆突性皮肤纤维肉瘤(Fibrosarcomatous DFSP,FS-DFSP),FS-DFSP 非常容易转移,预后比较差。目前国内对于该疾病的临床报道仍然比较少见。本研究的目的是描述DFSP临床和组织病理学特征,治疗效果,以及分析复发和转移的因素。方法:通过回顾性分析的研究方法,分析从1999年1月至2018年7月在我院治疗的DFSP患者的临床资料。进一步对肿瘤的发病部位、发病年龄等临床特征以及病理学特征进行描述性研究,同时对患者的复发、转移进行分析,研究的终点事件是重大疾病相关临床事件的发生率。结果:本研究共搜集254例患者的病例资料,其中男139例,女1 15例。DFSP诊断的平均年龄为38.4±12.3岁(范围:12-69岁),其中188例(74.0%)年龄在20-50岁之间,19例(7.5%)年龄≤20岁,47例(18.5%)年龄>50岁。肿瘤的发病部位主要在躯干,其次是上肢和下肢,分别为132例(52.0%)、55例(21.7%)和48例(18.9%)。有248例病理类型为经典型DFSP(Classical DFSP,C-DFSP),6例为罕见的FS-DFSP。经我院病理会诊发现,有49例患者在外院局部切除术后切缘阳性,有79例经我院术后病理证实肿瘤残留。共有211名患者的随访数据可供分析,平均随访时间为38(1-196)月。扩大切除术(Wide-local Excision,WLE)后5年无复发生存率为97.1%。与局部切除治疗的患者相比,接受WLE治疗的患者的局部复发率显著降低(2.9%VS 37.7%;p<0.001)。FS-DFSP的远处转移率(66.7%[n=4]VS 2.0%[n=4];p<0.001)和死亡率(50.0%[n=3]VS 1.5%[n=3];p<0.001)明显高于C-DFSP。本组共8例患者出现远处转移,远处转移最常见的部位是肺(n=8);总体远处转移率为3.8%(8/211),伴有远处转移的患者的1年生存率为87.5%(6/8),3年生存率为25%(2/8)。WLE后辅助放疗在提高肿瘤的无复发生存率方面,差异无统计学意义(p=0.056)。多因素分析发现转移是WLE后患者独立的预后因素(p=0.042)。单因素分析显示局部复发的主要因素和病理类型有关(χ2=6.443,p=0.011);FS-DFSP 比C-DFSP 更容易出现转移(χ2=19.522,p<0.001)。结论:DFSP是一种低度恶性的软组织肿瘤,罕见转移。局部切除后肿瘤的复发率较高,WLE是减少DFSP复发的有效方法。FS-DFSP的转移率明显高于C-DFSP,且预后比较差。WLE后局部的复发和转移主要和病理类型有关,辅助放疗不能提高肿瘤的无复发生存率。背景与目的:DFSP属于一种不常见的、伴有局部侵袭性的皮肤软组织肉瘤,发病率约为1/100,0000。虽然DFSP在组织形态学以及分子遗传学有一定的特征性,但由于组织学分型种类多,免疫组学尚缺乏特异性的蛋白分子。目前多数文章报道DFSP的发病机制与PDGFB、COL1A1两者产生融合基因有关,但是却很少有研究从差异蛋白组学的方面探寻该病的复发机制。本研究的目的通过对复发DFSP的肿瘤和瘤旁正常组织的蛋白组学差异分析,寻找能够引起DFSP复发的差异蛋白,并为DFSP的治疗,尤其是靶向药物的应用提供更多的研究证据。方法:采用定量蛋白质组学串联质谱标签(Tandem Mass Tag,TMT)标记技术对3例复发DFSP患者的肿瘤组织及对应的癌旁组织进行蛋白组学检测,并对差异蛋白进行生物信息学分析;包括差异表达蛋白筛选(Differentially Expressed Proteins),差异表达蛋白的层次聚类分析(Hierarchical Clustering Analysis),差异表达蛋白的GO注释富集分析(GO Annotation Enrichment Analysis),差异表达蛋白的KEGG注释(KEGG Pathway Analysis),差异表达蛋白的PPI网络构建分析(Protein-Protein Interaction Network Analysis),并通过GEPIA(Gene Expression Profilling Interactive Analysis)数据库分析差异基因与PDGFB、COL1A1是否具有相关性。结果:本研究中共筛选出377个差异蛋白,其中246个上调蛋白,131个下调蛋白。通过GO数据库匹配,结果差异蛋白参加的生物学过程(Biological process,BP)的条目有801个,分子功能(Molecular Function,MF)的条目1 12个,细胞组分(Cellular Component,CC)的条目174个。在BP方面,差异蛋白在mRNA的加工、RNA的剪接、以及有机化合物的代谢过程等发挥显著作用。在MF方面,差异蛋白在RNA的结合、核酸的结合、有机化合物的结合、蛋白质的结合等方面发挥显著作用。在CC方面,主要在细胞器形成方面发挥显著作用。KEGG分析显示差异蛋白参与了 18条信号通路,其中映射到剪接体通路差异表达蛋白数量最多。PPI网络分析连接度最高的10个基因分别是POLR2A、NCBP1、SF3B1、SNRPE、SNRPD1、SRSF1、SF3B3、PRPF31、POLR2I、HNRNPU。其中 POLR2A互作的基因/蛋白最多为39个(p=0.04073)。通过GEPIA数据库验证连接度最高的前10个差异蛋白基因,其中和COL1A1/PDGFB具有相关性的基因是POLR2A、SNRPE、SNRPD1、SF3B3、POLR21、SF3B1。结论:TMT定量蛋白组学标记技术能够筛选出DFSP肿瘤与正常组织之间的差异蛋白。差异蛋白在DFSP的发生发展过程中参与多种代谢通路,而POLR2A可能在DFSP的复发过程中发挥核心作用。
其他文献
背景高血压疾病作为高致死性的心血管及脑血管疾病的重要诱发因素,影响全球约14亿人口。截止至2018年,我国18岁以上成年人高血压的患病率为23.20%,35-75岁成年人中患病率高达37.20%,给个人、家庭和社会造成了沉重的疾病负担。大量研究证据证实高血压疾病与肝脏脂肪蓄积及肝脏代谢异常引起的血清脂蛋白异常密切相关。然而,血清丙氨酸氨基转移酶(Alanine aminotransferase,A
目的:初步测定嗓音质量指数(acoustic voice quality index,AVQI)在汉语普通话人群中的信度和效度。方法:50名嗓音正常者及50名嗓音障碍患者参与了这项研究。所有的受试者使用电子喉镜检查喉部结构,由两名专业的耳鼻喉科医生来判断喉功能是否异常。同时,受试者用汉语大声朗读一段构音平衡的句子及发元音/a:/超过5秒,并填写嗓音障碍指数问卷(VHI-30)的自我评估。两位专业的
第一部分肾癌自噬预后模型的建立与验证目的自噬是指细胞内的物质包被进入囊泡,运输到溶酶体并与其融合,最终降解的过程。机体借此实现细胞自身的代谢需要和某些细胞器的更新。现阶段研究已证实自噬失调与多种疾病有关,然而其在肾癌发生发展中的具体机制尚不明确。本研究旨在利用生物信息学分析法对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的肾癌肿瘤组织及癌旁组织数据进行筛选,并
[目的]本研究旨在梳理和分析国内外乳腺癌患者照顾者心理状态相关研究的现状,了解其发展全貌及趋势,为深入研究提供参考。[方法]通过计算机检索 PubMed、Embase、the Cochrane Library、Web of Science、中国生物医学文献数据库、中国知网和万方数据库等,筛选乳腺癌患者照顾者心理状态研究相关的文献。采用Excel2016软件进行数据整理,生成高产国家、高产机构及高频
[目的]国际癌症研究机构(IARC)2018年发布的全球癌症统计数据《全球癌症报告》指出,肺癌的发病率和死亡率跃居世界首位,分别占癌症总发病人数和总死亡人数的11.6%和18.4%。肺腺癌是肺癌的主要亚型,侵袭和转移是其不良预后的主要原因。胆固醇代谢在肿瘤增殖转移中的作用成为目前肿瘤研究的热点之一,由于胆固醇代谢的复杂性,其作用也是莫衷一是。胆固醇代谢物作用的不一致性可能解释了高胆固醇与肺腺癌不良
在肿瘤发生发展过程中,肿瘤抑制因子p53在调控肿瘤抑制方面发挥重要作用。越来越多的研究表明,p53介导的细胞周期阻滞、凋亡及衰老等经典的DNA损伤反应对于发挥p53肿瘤抑制作用并非完全必要。近年来发现p53在调控代谢、自噬、铁死亡及免疫等多种生物学过程中可能对肿瘤抑制起关键作用。但究竟何种生物学过程对于p53介导的肿瘤抑制起决定性作用仍尚未研究清楚,是否还有潜在的p53下游靶基因参与调控肿瘤抑制仍
背景和目的:食管鳞癌起源于食管鳞状黏膜上皮,是常见的恶性肿瘤,在我国食管鳞癌的发生率和死亡率都居世界前列。我们课题组已有来自高发区的食管鳞癌样本的全基因组测序数据,通过数据分析鉴定出了包含1,591个拷贝数扩增基因23个拷贝数扩增区段。通过整合分析94例食管鳞癌全基因组和转录组数据,发现食管鳞癌组织中有149个拷贝数扩增的基因存在异常高表达,这些基因可能与食管鳞癌有着密切的关系。因此,本课题的研究
败血症是病原菌感染导致全身性的急性器官功能损伤乃至危及生命的不受控制的炎症反应。据世界卫生组织的报道,每年死于败血症的病患达到30万人以上。败血症多为细菌感染,也有部分为真菌或者病毒感染所致。20世纪最伟大的发明之一是抗生素的发现和使用,抗生素在临床的使用大大的提高了感染性疾病患者的生活质量,然而抗生素的滥用也导致了耐药菌株的出现,甚至多重耐药的“超级细菌”。耐药菌感染导致的败血症不仅加重了医疗资
研究背景非ST段抬高型急性冠状动脉综合征(Non-ST-Elevation Acute Coronary Syndrome,NSTE-ACS)患者,冠状动脉粥样硬化病变的严重程度对治疗决策选择和预后判断具有重要作用。既往研究发现在接受经皮冠状动脉介入治疗(Percutaneous Coronary Intervention,PCI)的 NSTE-ACS 人群中,高危冠脉解剖(High-Risk C
背景非阵发性心房颤动(简称房颤)患者的导管消融结局不良。肺静脉电隔离是导管消融治疗房颤的基石。在非阵发性房颤患者中,肺静脉电隔离仅能使少部分患者的房颤终止并转复为窦性心律。伊布利特是一种Ⅲ类抗心律失常药,常用于房颤终止以辅助消融。本研究拟评估消融术中对伊布利特的心律反应和消融后长期房性心律失常复发的关系。方法回顾性地纳入138例首次行导管消融的非阵发性房颤患者。所有入组患者在肺静脉电隔离后房颤均未