从上世纪90年代以来,我国进行了以提高高校实力和资源共享以及办学效率为目的的高等教育结构调整和体制改革,通过对全国600多所高校进行合并,尤其很多高校强强联手,使得大学的综合实力迅速提高。从1999年开始,全国高等院校又面临扩招,高等教育迅猛发展,许多高校为了适应扩招的要求相继扩建或新建新校区,又形成了一大批多校区大学。多校区大学现已成为我国高等教育的一大特色。然而作为地方高校,在高校合并的过程中基本上是弱弱联手,虽然在综合实力有所提高,但和重点高校和省属省会城市高校相比,既没有学科的优势,又没有交通的便利,又缺乏大都市文化的底蕴。在这样的多元竞争的格局中,地方高校的办学管理模式,以及如何形成地方特色,就显得尤为重要。如何对区域分散的各个多校区进行协调管理,进行有效的资源配置、学科建设、校园文化建设,使地方多校区高校达到协调发展是目前我国高等教育面临的重大课题。吉首大学是湖南西部地区综合实力很强的一所地方高校,教育部普通高等学校本科教学工作水平评估优秀高校。本文以吉首大学为个案研究,在分析吉首大学的管理模式、运行机制等方面做了具体的分析,总结了吉首大学办学的成功经验,即结合实际,采用多种混合管理模式;科学发展,在运行机制上实行统筹优化。同时为解决目前地方高校多校区办学的教学管理体制中存在的主要问题提出对策,即探索适合自我学校发展的复合式管理模式;建立新型的管理体制和运行机制;建立理想的教学管理体系;优化教学资源的配置;加强地方多校区高校组织文化的建设。