论文部分内容阅读
黄瓜是一种受欢迎的蔬菜,在我国寒冷的季节广泛种植于塑料大棚中。土壤和根际含有十分丰富的微生物,其在促进黄瓜的健康生长中起着重要的作用。为了促进土壤改良和建立新的病害防治策略,采集湖北武汉、麻城和荆州塑料大棚黄瓜种植区的土壤和黄瓜根际土壤,并采用16s rRNA扩增子测序技术对土壤和黄瓜根际微生物组的结构和功能进行分析。主要研究结果如下:1.对塑料大棚土壤微生物组的结构和功能进行分析,结果发现:土壤微生物组的结构存在明显的区域差异。变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)是优势菌门,芽孢杆菌属(Bacillus)和鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)是优势菌属。土壤微生物组主要涉及氨基酸代谢、碳水化合物代谢、细胞生长和死亡等多种子功能。2.通过对根际微生物组结构和功能的分析,认为变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是优势菌门,芽孢杆菌属(Bacillus)和根瘤菌属(Rhizobium)是优势菌属。塑料大棚黄瓜根际微生物组的结构表现出明显的区域差异,并认为其主要涉及细胞生长和死亡、信号转导和细胞运动等多种子功能。3.根际与非根际微生物组之间结构和功能的差异比较结果表明,非根际土壤微生物的多样性显著高于根际土壤。变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)在根际土壤中的相对丰度是显著升高的,但是酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和绿弯菌门(Chloroflexi)在根际土壤中的相对丰度是显著降低的。根际和非根际微生物组具有不同的群落结构,但是它们的功能在进化过程中更为保守。4.采用相同测序技术分析黄瓜根际核心微生物组,发现其主要是由根瘤菌属(Rhizobium)、剑菌属(Ensifer)、链霉菌属(Streptomyces)、德沃斯氏菌属(Devosia)、梭形杆菌属(Lysinibacillus)、新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium)、双杆菌属(Dyadobacter)等24个菌属组成的。