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在海峡西岸经济区建设中占首要地位的林业是福建省的一大潜力、一大优势和一大保障。促进林业的可持续发展最终要依靠林业科技的进步与创新,特别是在新时期林业对科学技术的需求进一步扩大,而福建省林业科技的整体水平并不高。因此要发展林业科技,就必须加大对林业科研的投入力度。并在此基础上,有效利用林业科研投入资源,提升林业科研管理水平,提高林业科研的投入产出效率,优化资源配置,最终促进福建省林业科技水平的快速提高。本文以2006-2012年期间的福建省林业厅的林业科研项目为研究对象,对其投入产出效率展开研究。首先,运用描述性统计分析方法分别从投入角度和产出角度对2006-2012年福建省林业厅林业科研项目的整体情况展开分析。投入角度主要从林业科研项目立项数、科研经费资助、科研人员投入和科研时间投入方面展开,产出角度主要涉及林业科研项目的科技论文发表情况、科技论文被引用情况、科技奖励、成果鉴定等方面。其次,利用相关数据对2006-2012年福建省林业厅已结题验收的林业科研项目的投入产出效率进行测算分析。运用不同的方法对不同学科和不同科研经费水平的林业科研项目的投入产出效率进行测算。(1)运用投入产出比率法测算林业科研项目投入产出效率。结果表明:按学科分类,造林学、林木育种及造林技术学科的林业科研项目在科研经费投入综合效率、科研人员投入综合效率及综合效率上其效率值都最高;按科研经费分类,科研经费10万元以下和科研经费10-30万元的林业科研项目的效率值相对较高。(2)运用数据包络分析方法(DEA)测算林业科研项目投入产出效率。结果表明:按学科分类,8个学科的林业科研项目中有6个学科的林业科研项目DEA有效,2个学科非DEA有效;按科研经费分类,8类科研经费水平的决策单元为DEA有效,占整体50%;科研经费10-30万元的林业科研项目投入产出DEA效率值最高;科研经费10万元以下的林业科研项目次之;科研经费30万元以上的林业科研项目投入产出DEA效率值最低。