随着我国市场经济体制的完善,国民经济和社会的发展,公益性水利工程运行管理中存在的问题也日趋突出。公益性水利工程运行管理模式不合理、公益性支出没有补偿来源、管理粗放、国有公益性资产运营体制不完善等问题造成公益性水利工程得不到正常的维修和养护,致使其效益日渐衰减,难以达到原有设计标准,导致其安全隐患逐年加大,给国民经济和人民生命财产安全带来很大的潜在威胁。任何一项工程的实施均离不开运行管理这个环节,然而在水利建设与管理的实践中,长期以来存在着“重建轻管”思想。为了避免在公益性水利工程建成后出现弱化运行管理的问题,保证其维护资金及时到位,避免公益性水利工程建后出现老化失修的状况,有必要针对公益性水利工程运行管理实践中的特点和难点,构建一整套现代化的运行管理模式,保障公益性水利工程效益的持续发挥。在对公益性水利工程运行管理相关概念界定和文献研究的基础上,结合我国大江大河公益性水利工程运行管理实践的经验,总结提炼出三种运行管理组织方式和六种维修养护费分担和使用的方式,构建了公益性水利工程运行管理模式A×B矩阵,根据公共物品理论和组织极其设计理论对其可行的运行管理模式进行筛选和优化整合,确立三种最优的公益性水利工程运行管理模式,即垂直、省县分级和组合管理模式。结合指标体系的构建原则,构建公益性水利工程运行管理模式评价指标体系,并运用采用德尔菲法和信息熵的改进法对指标进行修正和筛选,确立包含四个维度的评价指标。构建公益性水利工程运行管理模式优选博弈模型,采用NASH均衡理论和基于剔除劣战略的整体效用最优法对其求解。最后依托三江治理工程运行管理模式的选择进行实证研究,验证公益性水利工程运行管理模式研究内容的科学性、合理性。公益性水利工程运行管理模式的研究,为我国公益性水利工程确立合理的运行管理模式提供可行方法,保障其效益的持续发挥,促进公益性水利工程健康可持续发展。