智利竹筴鱼是东南太平洋重要的中上层鱼类资源。为了确定智利竹筴鱼的种群结构,更好的管理智利竹筴鱼渔业资源,国内外学者从各个方面研究,至今都没有形成统一的观点。为此,我们运用形态学和随机扩增多态性DNA（RAPD）分析等方法,对分布在东南太平洋智利竹筴鱼的群体差异进行研究,从不同层面探究不同区域群体间的差异和特征,探究其遗传背景及相互之间的关系,从而确定竹筴鱼群体结构及其遗传多样性,为竹筴鱼渔业资源的合理利用提供科学依据。本文的研究结果如下:1.不同群体间形态学比较根据（35°S-40°S,86°W⁹0°W）（60尾）、（35°S-40°S,91°W-93°W）（80尾）和（35°S-40°S,102°W-103°W）（11尾）共计151尾,测定20项形态学指标,即6个可量性指标和13个框架指标,与全长相比获得19个形态学比例性状,运用差异系数检验、均数差异显著性检验、主成分分析和判别分析法对不同群体间的形态差异进行了比较研究。差异系数（C.D）结果表明,研究区域的智利竹筴鱼群体间尚未有达到亚种差异水平。通过均数差异显著性检验认为,（35°S-40°S,86°W-90°W）与（35°S-40°S, 91°W-93°W）海域间智利竹筴鱼群体形态学比例性状不存在显著性差异;（35°S-40°S,86°W-90°W）与（35°S-40°S,102°W-103°W）海域间智利竹筴鱼群体在Spl1/Tl、Ed/Tl、Hl/Tl、2-4/Tl、3-6/Tl、8-9/Tl等形态学比例性状上存在显著性差异;（35°S-40°S,91°W-93°W）与（35°S-40°S,102°W-103°W）海域间智利竹筴鱼群体在Spl1/Tl、Spl2/Tl、1-4/Tl、Hl/Tl、2-4/Tl、3-6/Tl、4-5/Tl等形态学比例性状上存在显著性差异。主成分分析结果表明,构成八个主成分对不同区域群体间总变异的贡献率分别为:36.792%、14.293%、6.835%、5.812%、5.138%、4.925%、4.588%、3.447%,累计方差贡献率为81.83%。在第一主成分中Spl1/Tl、Spl2/Tl、1-3/Tl、Hl/Tl、2-4/Tl有较高的负载系数（均大于0.7）。利用第一、第二主成分绘制散布图,可发现三个区域的不存在明显的差别。通过建立（35°S⁴0°S,86°W-90°W）、（35°S-40°S,91°W-93°W）和（35°S-40°S,102°W-103°W）等3个群体的判别函数,判别准确率分别为:63.3%、72.5%、72.7%。2.随机扩增多态性DNA分析从9条随机引物中筛选出4条引物,对（35°S-40°S,90°W-95°W）（pop1）、（35°S-40°S,100°W-105°W）（pop2）和（35°S-40°S,105°W-110°W）（pop3）等3个区域的146尾样本进行随机多态性DNA（RAPD）分析。结果显示扩增条带中共检测到52个位点,其中多态性位点为51个,多态位点占所有扩增位点的98.08%。群体的Shannon’s多样性指数为0.5202±0.1813,Nei’s基因多态性指数为0.3500±0.1440,种群间遗传分化指数GST为0.0311。结果表明该海域智利竹筴鱼群体的遗传多态性较高,但群体间不存在显著的遗传分化。90°W-95°W、100°W-105°W和105°W-110°W等群体内遗传相似度分别为:0.9731、0.9755、0.9784,而群体间遗传距离依次为:（35°S-40°S,100°W-105°W） ^{35°S-40°S,105°W-110°W}（0.0218）<（35°S-40°S,90°W-95°W）^{35°S-40°S, 105°W-110°W}（0.0248）<（35°S-40°S,90°W-95°W）^{35°S-40°S,100°W-105°W}（0.0273）.形态学和随机扩增多态性分析的结果表明,在东南太平洋区域（35°S⁴0°S,86°W-110°W）的智利竹筴鱼群体是属于同一个种群。