进出口商品许可证制度是国家通过外贸相关部门通过发放许可证的方式管制商品进出口的一项行政措施,是国家对外贸易政策不可或缺的一个重要组成部分。该制度是伴随对外贸易设立和发展的,并伴随着对外贸易的长足发展,发挥着越来越大的作用。本文研究的思路是在对进出口许可证制度进行了详细介绍的基础上,对许可证制度运行各个环节可能存在的问题进行描述和制度性的分析。从查找、分析、解决制度漏洞和缺陷的视角来进行理论论证和实践探索。文中对于进出口商品许可证制度的管理和运行的机制中出现的问题,借助新制度经济学的理论进行分析,用实证的分析方法查找出问题,对于存在的问题的成因、影响进行评估,运用博弈论的方法对于问题的解决方法进行论证。在提高制度的效用和降低制度运行的成本的目标指引下展开分析和讨论。通过对进出口许可证制度问题的实证分析,提出了现阶段该制度在管理体制和运行两个层面的改进措施,并构想了该制度未来的发展方向。