20世纪80年代以来，随着中国经济、政治和社会的发展，民间组织与社会治理问题受到了学者的广泛关注，大量相关研究相继出现。但是以往的研究多为理论分析，具体个案实证研究较少；在考察民间组织与政府的关系时，侧重于民间组织的功能性研究，民间组织自主性研究较少。本文将结合对杭州基督教男女青年会的多次调查和相关文献的查阅，力图从历史的维度来考察杭州基督教男女青年会与政府的关系变化情况，从而进一步分析转型时期民间组织与政府的关系。通过对目前学者关于民间组织和治理理论研究的梳理，按照参与主体的不同将社会治理分为政府治理、自主治理和合作治理三种类型，并力图从自主治理和合作治理两个角度来论述杭州基督教男女青年会参与社会治理情况。自主治理是民间组织应对转型时期的困境，通过加强自我协调和自我管理，主动参与社会治理，自主提供社会公共服务的过程；合作治理是民间组织与政府在社会公共服务提供方面的合作互动。笔者将从社会服务的参与主体、资金来源及服务提供等角度来具体分析杭州基督教男女青年会自主治理和合作治理，通过对杭州基督教男女青年会自主治理和合作治理的具体研究，来进一步探讨民间组织在社会治理中的路径选择问题。