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底栖甲藻是一类营底栖附着生活的微型藻类,与开放水域能形成赤潮的甲藻不同,它们并不形成水面藻华,而是主要附着于大型藻或者硬质死亡珊瑚表面。它们是底栖生态系统初级生产力的重要组成部分,常见的底栖甲藻包括前沟藻属(Amphidinium)、库利亚藻属(Coolia)、冈比亚藻属(Gambierdiscus)、蛎甲藻属(Ostreopsis),原甲藻属(Prorocentrum)。不同于浮游型甲藻,底栖甲藻往往多个种类在底栖生态系统中共同存在,但在生活史的大部分时间营底栖附着生活,因此野外样品不易获得;而且许多底栖甲藻能产生毒素与活性物质,毒素经食物网累积、传递后,对水产品食用安全具有较大威胁;另外部分毒素具有海洋药物资源开发利用前景。这些特点一方面使得开展底栖甲藻研究困难重重,另一方面提出加强研究的必要性。我国领土广阔,纵跨热带、亚热带和温带海域,岛屿众多,拥有适宜底栖甲藻生长的海域环境。位于热带北缘的广西北部湾涠洲岛珊瑚礁发育典型,属热带季风气候,气候类型利于底栖甲藻繁生。前人研究指出该岛存在冈比亚藻引起的雪卡毒素有毒鱼,因此本文于2014-2016年在涠洲岛珊瑚礁海域开展了底栖甲藻生物多样性研究。本研究以年为单位,潜水采集珊瑚礁海域的大型藻和死亡珊瑚礁层,收集附着其上的底栖甲藻,构建底栖甲藻纯培养株藻种库,通过光学显微镜和电子扫描显微镜获取细胞与甲板形状、大小、组成等图像信息,利用分子生物学技术进行特征基因D1-D3 rDNA、D8-D10 rDNA、ITS、SSU rDNA测序并构建系统发育树,从而综合形态学和分子生物学分类信息,完成该岛礁系统底栖甲藻生物多样性研究。本文主要取得了以下结果:1)明确了涠洲岛珊瑚礁海域底栖甲藻的群落结构、物种多样性特征,建立了包含5属6种67株的底栖甲藻纯培养株藻种库:A.carterae、A.massartii、C.malayensis、G.caribaeus、Ostreopsis cf.ovata和P.maculosum,除前沟藻记录到两个种外,其余均为一个种,且多为全球广布种。2)获取了涠洲岛珊瑚礁海域较为完整的基于光学显微镜和电子扫描显微镜的底栖甲藻形态学资料库,以及D1-D3 LSU rDNA、D8-D10 LSU rDNA、ITS、SSU rDNA特征基因序列信息。3)明确了该海域底栖甲藻的地理分布格局特征,即位于岛的东南面和西北面底栖甲藻种类多样性要高于岛的其它海域,分析与涠洲岛夏季流行西南季风,冬季流行东北季风相关,前者底栖生境受扰动较少,稳定的水体更有利于底栖甲藻存活。论文首次在广西北部湾涠洲岛珊瑚礁海域进行底栖甲藻生物多样性研究,成功建立了种层次分类明确的底栖甲藻藻种库,结果不仅为北部湾海洋环境保护如底栖藻华防灾减灾提供科学依据,而且为北部湾底栖甲藻生物资源开发利用提供物质基础。积极开展我国典型珊瑚礁海域底栖甲藻生物多样性研究,是对近些年海洋藻类学家提倡的开展海洋底栖甲藻多样性研究的积极响应,研究结果有利于改变我国该领域研究薄弱的现状,并为我国北部湾底栖甲藻后续研究奠定基础。