近年来随着我国中部崛起计划的实行，安徽省凭借自身自然资源较为丰富，劳动力成本相对较低，市场潜力较大等优势，积极主动承接国内外产业转移。合芜蚌三市作为安徽省的核心城市，如何科学承接产业转移以提高自身的自主创新能力，就显得尤为重要。　　学术界关于产业转移和自主创新关系的研究，大多是从国际产业转移的角度来进行研究，对于以区际产业转移为角度来分析自主创新能力的研究较少，其中有关区际产业转移对自主创新影响的研究也大多是从宏观的角度来进行分析的。本文将区际产业转移与自主创新相结合，研究承接产业转移对合芜蚌新区自主创新的影响。通过探讨产业转移对合芜蚌新区创新能力和效率的影响，对于安徽省产业结构升级和经济发展有着明显的现实意义。　　本文认为产业转移主要以劳动密集型产业转移、资本密集型产业转移、技术密集型产业转移三种方式进行产业转移，并从理论上分析了这三种产业转移方式对产业承接地自主创新的影响机理。在理论分析的基础上，本文根据合芜蚌新区的现状，进行了相关的实证分析。首先对合芜蚌新区自主创新能力的现状进行分析，运用主成分分析法和雷达图分析法综合评价合芜蚌新区三个城市的自主创新能力；然后建立计量模型，分析了承接产业转移对合芜蚌新区自主创新的影响，即研发活动的资金投入和实际利用外资额对合芜蚌自主创新产出能力的变动具有正向促进的作用，而人力资本投入和利用省外资金额对对合芜蚌自主创新产出能力的变动具有负向的作用。因此，合芜蚌新区在承接产业转移过程中，要有选择地承接产业转移，要改善和优化产业转移环境，积极推动和引导企业自主创新。