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小型底栖动物是许多经济鱼、虾和贝类幼体阶段的优质饵料，是底栖食物网中十分重要的一环。小型底栖动物的群落结构、多样性格局和生物量变动直接控制着大型经济无脊椎动物幼体的补充，在海洋生物地球化学循环中占有重要位置。红树林和盐沼湿地是我国东南沿海潮间带典型的生态系统，与红树林和盐沼湿地大型底栖动物的研究比较，小型底栖动物的研究在我国属起步阶段。
2010年1月、4月、7月和10月，对福建漳江口红树林和盐沼湿地的四种植物生境进行了小型底栖动物采样，随后在实验室采用分选、镜检、数理统计等方法，研究了小型底栖动物的类群组成和丰度、自由生活线虫的群落结构和多样性，以及根据大型和小型底栖动物生物量构建了生物量粒径谱，以期为底栖动物多样性和红树林保护提供基础研究。主要研究成果如下:
1.四个季度共获取14个小型底栖动物类群，分别是自由生活海洋线虫、底栖桡足类、多毛类、寡毛类、介形类、动吻类、海螨类、轮虫类、原足类、纽虫类、昆虫类、枝角类、涡虫类以及其它未鉴定类群。其中自由生活海洋线虫是最优势的类群，占总丰度的89.6％;居于第二位的是底栖桡足类，占总丰度的7.6％，其次为寡毛类（占1.8％），其它类群所占比例较小。
2.在漳江口红树林和盐沼湿地，小型底栖动物的平均丰度为2242.6±213.2ind·10cm-2，冬季的丰度最高，依次分别是春季、夏季和秋季。单变量双因素方差分析(Two-wayANOVA)表明，小型底栖动物丰度无显著季节差异(F3,80=1.193，P＞0.05);不同植物生境之间呈极显著差异(F3,80=9.402，P＜0.01)，季节×生境之间无显著差异(F9,80=0.844，P＞0.05)。
3.小型底栖动物的平均生物量为2051.1±366.5μg·dwt·10cm-2，生物量随季度的排列顺序为:冬季＞春季＞夏季＞秋季。Two-wayANOVA分析表明，小型底栖动物生物量无显著季节差异(F3,80=1.581，P＞0.05);不同植物生境之间呈极显著差异(F3,80=10.057，P＜0.01)，季节×生境之间无显著差异(F9,80=1.054，P＞0.05)。
4.冬季、春季共鉴定出自由生活海洋线虫59种（分类实体单元），计算了线虫群落的多样性指数，做出线虫群落的K-优势度曲线，得出冬季互花米草生境的物种多样性最低。
5.在不同植物生境，线虫的不同营养类型所占比例也不同。在冬季、春季，秋茄、桐花树生境均是非选择性沉积食性者(1B)最占优势;而在白骨壤、互花米草生境，刮食者(2A)占绝对优势。
6.在不同植物生境下，线虫优势种有所不同。在秋茄生境，冬季、春季海洋线虫的第一优势种分别为花斑线虫Spilophorellasp.2和吞咽线虫Daptonemasp.。在桐花树生境，冬季和春季海洋线虫的第一优势种均为萨巴线虫Sabatierisp.。在白骨壤生境，冬季和春季第一优势种均为花斑线虫Spilophorellasp.1。在互花米草生境，冬季和春季第一优势种均为后菱光线虫Metachromadorasp.。
7.对漳江口不同植物生境底栖动物的正态化生物量粒径谱截距、最小粒级的生物量(BMS)进行比较，可以发现，在白骨壤和互花米草生境的截距、BMS高于秋茄和桐花树生境，这说明白骨壤和互花米草生境的生产力水平较高。