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大豆起源于中国，有着悠久的种植历史，但同时各种病虫害的危害也一直困扰着大豆生产。其中大豆花叶病毒病和大豆食叶性害虫是危害当今大豆生产的两大主要因素，大豆花叶病毒病由大豆花叶病毒（SMV）引起，是侵染大豆的重要病毒之一，在大豆产区分布广，危害严重，严重影响大豆的产量和品质。此外，我国各大豆产区同时也受到不同程度的食叶性害虫危害，造成的损失同样是巨大的，在危害严重年份，常常把大豆叶片吃光或仅剩叶脉，造成大豆产量严重损失。然而，目前我国生产上种植的大豆品种大多不抗大豆花叶病毒病和食叶性害虫。所以开展大豆种质资源抗病、虫性的遗传分析，定位新的抗病、虫基因，利用分子标记辅助选择（MAS）方法培育高抗大豆病、虫新品种是当前大豆育种的重要任务。本研究以科丰1号为母本，南农1138-2为父本杂交构建的重组自交系（RIL）群体NJRIKY F7:11为材料，利用分子标记对该群体进行评估，构建了该群体的基于PCR标记的分子遗传图谱。针对大豆花叶病毒的流行株系群进行了抗性遗传分析和抗性基因的定位研究，并利用该RIL群体对大豆食叶性害虫进行了抗性遗传分析和抗虫QTL的定位研究，主要结果如下：1．选用822对覆盖大豆全基因组的SSR引物，1对SCAR引物及由大豆EST设计的8对引物对RIL群体NJRIKY经调整后的184个家系进行群体遗传结构的分析，结果表明，绝大多数SSR座位趋于纯合；所有家系基本纯合；母本科丰1号及父本1138-2对群体的遗传贡献分别为0.507和0.493，群体各家系基因型组成符合正态分布；对各家系间的根井遗传距离采用UPGMA法对群体进行聚类分析表明群体中很少存在代表性重复现象。评估结果说明该群体遗传结构合理，分离情况良好，适合于遗传作图等遗传研究。2．应用RIL群体NJRIKY构建了一张包含20个主连锁群及5个小连锁群共25个连锁群的基于PCR标记的遗传图谱，其中包括271个SSR标记、1个SCAR标记、1个CAPS标记、2个形态标记和1个抗性基因共计276个座位。总长度为3179.8 cM，标记间平均间距为11.5 cM。图谱上的主要的标记为微卫星标记，与公共遗传图谱具有很好的可比性，标记的顺序和距离都很好地符合公共遗传图谱。将大豆黑色种皮基因I定位于G2-A2连锁群，与标记Sat162相距1.2cM；将大豆花色基因W定位于G11-F连锁群，与标记AW186493相距7.7cM。3．对中豆5号（感病）×邳县茶豆（抗病）的P1、P2、F1、F2接种大豆花叶病毒SC-8株系群进行鉴定，F1表现抗病，F2抗感分离比符合3：1的分离，初步表明邳县茶豆对SC-8的抗性由一对显性基因控制。对科丰1号×南农1138-2的P1、P2、F1、F2及RIL群体分别接种SC-3和SC-7株系群鉴定，初步表明，科丰1号对SC-3株系群的抗性由两对基因控制，科丰1号对SC-7株系群的抗性由一对显性基因控制。利用RIL群体NJRIKY构建的遗传图谱，联合抗性鉴定数据和分子标记数据，用MAPMAKER／EXP 3.0b进行连锁分析，将大豆对SC-7株系群的抗性基因Rsc-7定位于G8-D1b+W连锁群上，有5个SSR标记Satt266、Satt634、Satt558、Satt157和Satt698与该抗性基因Rsc-7连锁。4．以RIL群体NJRIKY为材料，在室内养虫条件下，以喂养的斜纹夜蛾幼虫重、蛹重为抗性鉴定指标，应用主基因+多基因的混合遗传模型对大豆对斜纹夜蛾抗性的遗传进行了分析。结果表明，该群体对斜纹夜蛾的抗性遗传无论以幼虫重还是以蛹重为抗性鉴定指标均符合两对主基因+多基因的混合遗传模型，主要表现为主基因的遗传，其主基因的遗传率分别为66.48％和67.96％。利用RIL群体NJRIKY构建的遗传图谱，采用软件Cartographer V.2.5和复合区间作图法检测到1个以幼虫重为指标的抗性QTL，位于G20-O连锁群上，其端距离为31.91cM，加性效应估计值为0.0408，对性状变异的解释率为11.74％；检测到2个以蛹重为指标的抗性QTLs，分别位于G8-D1b+W和G17-L连锁群上，其端距离分别为14.71cM和0.01cM，加性效应估计值分别为-0.0139和0.0103，对性状变异的解释率分别为11.30％和6.36％。