内含特定PIK3CA基因突变检测质控物的研制及其应用研究

来源 :湖南师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:haliluluya
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:研制内含特定PIK3CA突变基因并可模拟真实临床样本的质控物,在临床实验室将其用在基因突变检测室间质量评价预研活动中,讨论该质控物的实用性和各临床实验室检测PIK3CA基因突变的能力。方法:人工制备含有5种不同PIK3CA基因型人乳腺癌细胞系和人结直肠癌细胞系的甲醛固定石蜡包埋样本,依次用4%中性甲醛溶液固定、梯度乙醇脱水、二甲苯透明及石蜡包埋后再次包埋切片;通过HE染色直接评价切片细胞含量;每100支初步质控物中抽取6支样本进行DNA提取并进行浓度测定,并将制备好的质控物分别放置在37°C、室温(20~25°C)和2~8°C进行稳定性测试;PCR-Sanger测序和扩增阻碍突变系统法对不同基因型进行验证后,组成PIK3CA基因突变室间质量评价预研样本盘发放至各临床实验室,同时将样本盘送往三家国内权威实验室进行检测;统计分析各实验室回报结果。结果:切片细胞含量足够,分布均匀,每支样本DNA浓度均大于500 ng,在37°C、室温(20~25°C)和2~8°C条件下可以稳定保存至少6个月;PCR-Sanger测序和扩增阻碍突变系统法对不同基因型进行验证结果与预期相符;对各实验室回报的结果进行统计分析显示,2015年PIK3CA室间质评预研收到75份有效回报结果。检测结果完全正确实验室比例为25.33%(19/75),所有参评实验室检测的假阴性率为18.67%(112/600),假阳性率为17.33%(26/150)。所有参评实验室检测的阳性样本符合率为62.83%(377/600),阴性样本符合率分别为79.33%(119/150)。使用最多的检测方法是扩增阻滞突变系统法(ARMS)方法。结论:本研究成功建立了人工制备内含特定PIK3CA基因突变检测质控物的方法并应用于室间质量评价预研;研制的质控物比临床病理样本来源广,更稳定,异质性小,容易大量制备,可有效用于PIK3CA基因突变检测室间质量评价;2015年室间质量评价预研结果显示,各实验室在样本总体符合率上不高,假阳性率和假阴性率一直是影响突变检测正确率的主要因素。
其他文献
<正>提高400米成绩的方法是多种多样的,特别是科学、系统、合理力量练习手段的采取,体现效果至关重要。本文以佛山市5名专项为400米的男运动员为对象进行研究1、青少年男子40
采用常规拉伸性能测试、中心裂纹疲劳裂纹扩展速率测试及透射电镜分析研究了2A97铝锂合金1.5 mm厚度薄板T3态(6%冷轧预变形后自然时效)及T8态(6%冷轧预变形+150℃)时效时拉伸性能
<正>有诗云"横看成岭侧成峰,远近高低各不同"。此种看待问题的思想对于历史学科高考来讲也是实用的。自2016年始众多省份历史高考使用全国Ⅰ卷,为了备考对全国Ⅰ卷分析研究自
<正> 粘结剂和粘结技术的应用,在我国已经有几千年的历史了。例如一千五百年前,我国劳动人民就用粘结剂来粘合木材,并用于雕刻等。在元代应用粘结剂来粘结弓。至于浆糊、动物
<正>模具是利用特定的形状去成形具有一定形状和尺寸的工具,模具是汽车工业的基础工艺装备,在汽车生产中90%以上的零部件都需要依靠模具成形。制造一辆普通轿车大约需要近200
本文以再入段弹道预报为背景,主要解决多个模型关键参数未知情况下,再入大气层机动弹头的弹道精确外推问题。文章细化了再入段机动弹头的建模过程,建立了包含导引过程的有控
<正> 吉尔吉斯共和国政府首脑尼古拉·塔纳耶夫在资助国协商会议上作题为“宏观经济状况与前景”的报告时指出,采矿业是吉尔吉斯斯坦经济发展的战略方向.工业(包括冶金生产)
谷蛋白亚基组成对小麦加工品质具有重要作用。以豫麦34、藁城8901和中优9507为优质亲本,以轮选987、石4185和周麦16为农艺回交亲本, 采用5+10亚基和1B/1R易位分子标记结合田
<正>2017年高考结束,2018年备考工作也随之展开。在高三备考中,大量的模拟训练必不可少,但能否真正发挥其作用,提升学生的思维能力,这取决于模拟试题的质量。笔者尝试以2017
目的观察中药联合文拉法辛治疗难治性抑郁症的疗效。方法将82例病人随机分为研究组和对照组,研究组采用中药联合文拉法辛治疗,对照组采用文拉法辛治疗。在治疗前及治疗第2周