自1996年8月29日发布修改后的《中华人民共和国矿产资源法》以来，我国已基本形成矿产资源有偿使用制度的框架，它是由一系列的政策和法规所规定的税、费收取政策组成的。由于这些政策是在不同背景下形成的，因而存在一定问题和矛盾。在经济全球一体化、资源与环境的关系日益紧张的今天，有必要站在系统的角度，重新审视现行的煤炭资源税费制度。论文在现有研究基础之上，对比国内外的煤炭税费制度，立足于国内实际，从理论和实践两方面对当前煤炭税费制度改革进行研究：一是采取定性、定量结合的研究方法，从我国煤炭税费制度现状入手，对其进行系统分析；二是以煤炭税费制度作为一个系统工程，站在全局的角度构建煤炭税费制度评价指标体系，通过实证方法提出煤炭税费制度的改革方案；三是比较当前其他国家矿产资源税费制度，为国内煤炭资源税费制度的改革调整提供依据和参考；四是对我国煤炭税费制度的改革提出政策建议。论文首先从煤炭在我国经济发展中的重要地位出发，探讨了煤炭税费制度的目标与特殊性，梳理了国内外学者对于矿产资源税费、煤炭税费的相关研究成果，为本研究提供必要理论基础。其次对我国煤炭税费制度现状进行了分析，介绍了我国煤炭税费制度的历史沿革，对我国煤炭行业税费负担进行了实证研究，并指出我国煤炭税费制度现存的问题。即煤炭行业税负不公；煤炭行业税费交织，设计不合理；煤炭行业税收征管混乱等。分析其成因包括：增值税税负过重；资源税设计不合理；其他税费过多过杂等。为了更好地对我们国煤炭税费制度进行改革调整，作者对国外矿产资源税费制度进行了对比，包括东盟国家、以哈萨克斯坦和蒙古国为代表的中亚国家、以秘鲁和巴西为代表的南美洲国家、美国、加拿大、澳大利亚、俄罗斯的矿业管理体制及其税费制度，从中得出一些有益的见解供国内煤炭资源税费的改革调整参考。最后对煤炭税费制度的改革方案进行研究。从系统的角度提出煤炭税费制度改革的原则和思路，构建煤炭税费制度评价指标体系，应用基于信息熵复杂测度方法对其方案进行排序，遴选了煤炭税费制度方案并对其进行分析。根据评价结果，对煤炭税费制度改革提出政策建议，调整资源税、煤炭资源补偿费实行浮动费率制、进行增值税转型，适当征收所得税，为应对增值税对矿产资源利用的负面影响和保护性利用煤炭资源，强调环境、社会的协调发展，提出了税收抵扣及补贴并建立生态保证金制度。该论文有图11幅，表22个，参考文献115篇。