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制全貌，为临床诊治提供新的潜在靶点。 材料与方法：1、收集10例施行正位肝移植的HCC患者的癌、癌旁和正常肝组织，应用H&E染色确认相关组织的病理类型，应用Trizol一步法抽提配对组织的总RNA；2、应用1％琼脂糖凝胶电泳和芯片实验室(Lab-on-chip)进行RNA质量检测；3、按QIAGENRNeasy(?) Mini Kit说明，进行总RNA纯化、逆转录cRNA合成、荧光标记和纯化；4、将癌组织和正常肝组织、癌组织和癌旁肝组织的cRNA探针分别与Agilent寡核苷酸芯片(21，073探针)进行杂交，洗涤后应用Aailent Scanner获取图像，应用Feature Extraction软件进行定量分析处理，应用cluster分析软件进行聚类分析，通过Treeview软件以树状图形式显示；5、挑选明显差异表达的代表基因4个，其中包括上调和下调基因各2个，以β-actin为内对照基因，由上海生工生物公司设计合成目的基因引物前导链和后随链，按Invitrogen RT-PCR kit说明进行SYBR Green Ⅰ染料掺入的荧光real time RT-PCR绝对定量验证分析；6、挑选差异表达的代表基因6个，其中包括5个上调基因和1个下调基因，在高通量肝癌特异性组织芯片(产品批号：OD-CT-DgLiv01-001)上应用S-P法验证代表基因在蛋白水平的表达，采用SPSS10.0软件包分析相关基因的表达与HCC临床病理参数之间以及基因相互之间的相关性。 结果：1、H&E染色结果显示癌、癌旁以及正常肝组织呈现典型的组织病理变化，1％琼脂糖凝胶电泳和Lab-on-chip电泳结果均提示提示配对组织总RNA的质量高，无降解现象。2、高通量Agilent寡核苷酸芯片扫描发现在癌和癌旁组织的差异基因表达谱中，2倍上调的的差异表达基因(differentially expressed genes，DEGs)共1295个，而癌与正常肝组织的数目为1074个，综合两者的共同DEGs，共420个；相应的，在癌和癌旁组织2倍下调的DEGs共1320个，而癌与正常肝组织的数目为1107个，共同下调的DEGs为552个。3、Cluster聚类分析显示HCC的发生发展过程涉及癌基因与抑癌基因、编码离子通道和蛋白转运相关的基因、编码细胞周期相关蛋白的基因、与细胞应激相关的基因、细胞骨架和运动相关的基因、细胞凋亡相关的基因、调节DNA合成、修复和重排相关的基因、细胞因子受体相关基因、免疫蛋白相关基因、细胞代谢相关基因、信号转导相关基因、调节转录的基因、与生长发育相关的基因等，尚有部分基因不能分类或为表达序列标签(expression sequence tags，ESTs)。4、差异基因表达谱中，包含12个5倍以上上调表达的基因，分别是CTHRC1、UCHL1、PPP1R9A、CTSL2、POSTN、NQO1、DKK1、AGR2、MMP-12、SULT1C1、LAPTM4B和PEG10；7个10倍以上下调表达的基因，分别是3个细胞色素P450基因(CYP2C9、CYP2A7和CYP2C8)、