鸭OIH、FSHβ基因多态性及其与产蛋性状的关联研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:krist2009
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本研究以卵抑制剂(OIH)基因和促卵泡激素(FSHβ)基因为鸭产蛋性状相关候选基因,先克隆获得了两基因部分序列,并采用DNA池技术检测了两基因的DNA多态性,两个基因各选择两个SNP位点做PCR-RFLP,以连城白鸭与白改鸭杂交第3代群体为材料,检测各个体的基因型并研究性状的关联,主要研究结果如下:1.克隆获得了鸭卵抑制剂(OIH)基因Exon10-Exon12和Intorn10-Intorn12的部分序列,采用DNA池加测序的方法对鸭卵抑制剂(OIH)基因编码区及其侧翼序列进行SNP扫描,共检测到4个新的SNP位点,其中位点c.316A>G和c.1287 A>C分别导致了限制性内切酶Acc I和Alu I酶切位点多态性的改变。在连城白鸭与白改鸭杂交第3世代群体中,c.316A>G位点等位基因G和A频率分别为0.33和0.67,c.1287 A>C位点等位基因C和A频率分别为0.91和0.09;关联分析结果显示,位点c.316A>G与群体的420天产蛋量(P=0.05),蛋壳强度(P<0.05)存在显著相关,与390天产蛋量(P=0.08)相关程度接近显著水平;位点c.1287 A>C与连城白鸭与白改鸭杂交群体的270天产蛋量(P<0.05),300天产蛋量(P<0.05),330天产蛋量(P<0.01),360天产蛋量(P<0.01),390天产蛋量(P<0.01),420天产蛋量(P<0.01)存在显著相关或极显著相关。2.扩增获得了鸭促卵泡激素(FSHβ)基因第三外显子部分编码区序列;在鸭FSHβ基因序列中共检测到7个新的SNP位点,其中位点c.82C>G和c.308T>G分别导致Alu I和Ban II酶切位点的改变;在连城白鸭与白改鸭杂交第3世代群体中,c.82C>G位点等位基因C和G频率分别为0.24和0.76,c.308T>G位点等位基因T和G分别为0.64和0.36;性状关联分析结果表明,位点c.82C>G与连城白鸭与白改鸭杂交群体的开产蛋重(P<0.01)、蛋白高度(P<0.05)存在显著或极显著相关;位点c.308T>G与连城白鸭与白改鸭杂交群体的120天产蛋量(P<0.01)存在极显著相关,与开产日龄(P=0.06)相关性接近显著水平。3.利用PHASE软件对以上两基因突变位点进行了单倍型重构,在连城白鸭与白改鸭杂交第3世代群体中,性状关联分析结果表明,OIH基因重构二倍体型与连城白鸭与白改鸭杂交群体的后期产蛋量(EP330d,EP360d,EP390d,EP420d)存在显著相关(P<0.05),FSHβ基因重构二倍体型与连城白鸭与白改鸭杂交群体的早期产蛋量(EP120d,EP180d,EP210d,EP240d)存在显著(P<0.05)或者极显著(P<0.01)相关。
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