寡孢节丛孢产生分生孢子的分子机制初步研究

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寡孢节丛孢(Arthrobotrys oligospora)是一种丝状真菌,是研究捕食线虫真菌与线虫相互作用的模式菌株。寡孢节丛孢是一种土壤习居真菌,它可以在土壤中营腐生生活,也能产生三维菌网(three-dimensional traps,3-D trap)捕食线虫而营寄生生活。本论文以寡孢节丛孢为出发菌株,以2个产孢调控基因(fluG: AOL_s00043g361、 abaA:AOL_s00080g63)为研究对象,通过基因敲除的方法研究了fluG和abaA在寡孢节丛孢产生分生孢子过程中的功能,同时通过基因表达谱测序(RNA-seq)比较了寡孢节丛孢和ΔabaA突变株在产孢过程中的基因表达差异。主要实验结果:1. fluG和abaA这两个产孢调控基因的序列分析和功能结构域预测。对fluG和abaA这两个产孢调控基因进行了氨基酸及蛋白功能结构域预测和分析,fluG蛋白含有928个氨基酸,分子量为104.5kDa, pI为5.94,含有3个结构域,分别为glutamine synthetase/guanido kinase (catalytic domain)、 amidohydrolase2蛋白含有588个氨基酸,分子量为glutamine synthetase (catalytic domain)。 abaA为5.5,含有1个67.5kDa, pI结构域。TEA/ATTS和2. fluG基因的敲除、突变菌株的筛选和表型特征分析。通过电转abaA化酵母和大肠杆菌感受态细胞,构建了和fluG这两个产孢调控基因的敲除abaA载体,并运用介导的转化方法,对寡孢节丛孢原生质体进行了转化,CaCl2-PEG两个产孢调控基因均获得了阳性转化子。针对野生型和敲除株进行了生长速率、产孢、捕食器官形成和抗逆性等方面的比较,结果表明,两个产孢调控基因在一定程度上都与菌丝的生长与分化、产孢及孢子梗形态及抗逆性有关,基因对fluG产孢数量影响不明显,而基因对产孢的影响非常显著,其突变株在不同培abaA养基上培养都不产生分生孢子。3.寡孢节丛孢野生菌株、和ΔfluG突变菌株中产孢相关基因表达水ΔabaA平的分析。收集在同一种培养基上培养到不同时间点的突变株和野生株的样品进行总RNA提取,反转录获得并选取了产孢调控相关的30多个基因进行cDNA,荧光定量PCR分析,结果显示,基因对这30多个产孢调控基因的表达量影fluG响不明显,有3个基因的表达量变化达到2倍以上,但是,abaA基因对20多个产孢调控基因的表达量影响较为明显,有12个基因的表达变化量达到2倍以上,由此推测abaA基因在分生孢子的产生过程中发挥重要作用。4.寡孢节丛孢和ΔabaA突变株的基因表达谱测序(RNA-seq)分析。收集ΔabaA突变菌株和野生菌株培养5d、8d、11d的菌丝,提取总RNA,对其进行了表达谱测序和数据分析,比较野生型菌株和ΔabaA突变菌株在产孢过程中不同时间点的表达水平的变化,筛选得到了若干个可能和孢子产生调控相关的基因。本文的创新点:1.成功敲除了寡孢节丛孢基因组中2个产孢调控基因,并对野生型及敲除突变株的部分表型和生理生化特征进行了比较,初步推测了它们的功能。2.利用数字表达谱技术,比较野生型菌株和ΔabaA突变菌株在产孢不同时间点的表达水平的变化,筛选得到了若干个可能和孢子产生调控相关的基因,为进一步阐明孢子形成的分子机制奠定了基础。
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