CACNA1S基因是L-型钙离子通道α1亚单位的编码基因,L-型钙离子通道是镶嵌于膜脂质中的由多个亚单位组成的蛋白复合体,广泛存在于细胞膜表面形成功能单位或蛋白小孔,参与机体代谢,控制着离子转运与细胞的功能,具有重要的生理功能。对于CACNA1S基因的研究,主要集中在人和模式动物上,在畜禽动物上的研究较少见。本实验参照人和猪CACNA1S基因序列设计引物,克隆猪CACNA1S基因的核酸序列,然后借助PCR-SSCP技术检测单核苷酸多态性,分析突变位点与肉质性状的关系,为猪肉质性状的选育提供理论依据和技术支持。1 CACNA1S基因的克隆本实验根据人CACNA1S基因序列设计引物,通过RT-PCR和跨内含子扩增等方法得到猪CACNA1S基因约2187 bp外显子序列。以人为基准,进行比对,可知包含20个外显子,同源性为87.7%-92.4%。通过跨内含子设计引物,获得第37内含子235bp的核酸序列,与人同源性为44.4%。2 CACNA1S基因多态性与肉质性状的关系本实验运用PCR-SSCP技术和引物1S-62、1S-63、1S-65、1S-66、1S-75、1S-76在猪CACNA1S基因长度为1780bp的DNA序列中检测到34个SNP突变点；运用1S-46、1S-47、1S-61、1S-64、1S-69、1S-70、1S-71、1S-72、1S-73和1S-74等10对引物在苏钟猪、梅山、二花脸、淮猪、姜曲海等5个猪群中验证性的检测到56个SNP突变点。SNP检测与肉质、胴体性状关联分析,结果显示：1S-75对肉色(a)、肉色(h)、眼肌面积、粗脂肪重均存在极显著影响(P≦0.01),对肉色(a)的影响呈现AA>AC>CC>BC>BB>AB>AD的规律,对肉色(h)的影响呈现AA>CC>AC>BC>BB>AB>AD的规律,对眼肌面积的影响呈现CC>AC>BC>BB>AA>AB>AD的规律,对粗脂肪重的影响呈现AD>AB>AA>AC>CC>BC>BB的规律.位点1S-76对体长达到显著性水平(0.01<P<0.05),BB基因型猪的体长明显大于AA、AB基因型猪(P分别为0.044,0.031)。1S-62对肉色(h)(P=0.062)、眼肌pH值(P=0.073)的影响均接近显著水平。1S-65对后腿肌肉重和后腿pH值均存在显著影响(0.01<P<0.05),其中对后腿肌肉重的效应以基因型AA、BB显著大于AB基因型(P分别为0.006、0.015),对大腿pH值的效应以AB基因型显著大于AA基因型(P为0.027)。1S-66对蹄重存在极显著性影响(P<0.01),对蹄重的效应以BB、BC基因型极显著大于CC基因型(P分别为0.001、0.002)；1S-66对后腿肌肉重(P=0.061)、眼肌面积(P=0.056)的影响均接近显著水平,各基因型间的最小二乘均值均呈现BB> BC> CC的规律,其中对后腿肌肉重的影响BB基因型明显大于BC基因型(P=0.031).