自改革开放以来，我国科技发展水平发生了翻天覆地的变化，总的来说，面对不断变革的科学技术、日益强化的资源环境约束和以创新和技术升级为主要特征的激烈国际竞争，我国的创新能力薄弱的问题已经日益成为发展的瓶颈制约。目前，我国将提升国家创新能力的厚望给予高校，并且也给予了大量物质上的支持，高校已成为是摸索前沿技术和培养创新能力的重要基地，科研工作也已成为高校的三项重点工作之一，处在国内高校工作的核心位置。虽然目前科研工作已取得不错的成绩，但是制约高校科研工作推进的问题也随之出现，尤其以科研管理工作不能跟上科研工作的发展为主要问题。科研管理机构肩负着对高校科研发展规划和科技管理政策的制订、实施，以及对科研项目、科研组织、科研效果等方面进行评估和管理的重任，对高校的科研工作的发展具有十分重要的作用。面对国际竞争的挑战，现行的科研管理模式在观念和手段上都必须引入创新机制，遵循科学研究规律，从管理理念、管理模式、管理制度上进行改革创新，实现高校科研事业的跨越式发展。在本文中，首先介绍了关于科研管理的相关理论，分析了国内外高校科研管理和科研管理评价的经验和教训。其次，以A大学B学院为研究基础，阐述了B学院目前的科研管理现状，深入的剖析了科研管理存在的问题。再次，根据科研管理评价体系的构建原则以及B学院科研管理所面临的环境，建立了科研管理评价模型。运用层次分析法，在评价模型的基础上运算出评价指标的权值。最后，根据评价指标权值，提出A大学B学院科研管理体系的改进对策。