猪THRSP基因启动子SNP及其对基因表达的影响

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wenshicai2009
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猪肉是中国消费者动物蛋白质来源之一,猪肉品质一直倍受人们的关注。猪肉中的脂肪及其含量是猪肉品质和风味形成的重要决定因素,决定了猪肉的多汁性和口感。THRSP基因参与调控猪肉脂肪沉积,该基因的变异是调节脂肪合成和分解相关基因表达的关键因素。本研究以定远猪类群为材料,检测获得T HRSP基因启动子区5个SNP位点,构建了5个基因型的双萤光素酶报告基因重组质粒,并与pRL-CMV质粒共转染293T细胞,利用荧光素酶检测系统对转染细胞进行检测,分析不同基因型启动子的效率,并通过THRSP基因表达的实时荧光定量PCR和不同类型猪该基因的频率分布验证结果,分析启动子SNP位点与THRSP基因表达之间的关联性。结果表明:研究所发现的5个突变位点分别是位于CDS上游的A-95T、G-98A、A-376G、T-400C和C-459T,并且位于THRSP基因的启动子区域。利用5个SNP位点的联合基因型构建双萤光素酶报告基因重组质粒,与pRL-CMV共转染293T细胞,检测其转染后的启动子效率以TCAGA联合型最高,TCAGA的启动效率较CTGGA高129%,CCAGA、 CTAGA和CTGAT的启动效率较CTGGA分别低99%、73.2%和42.6%。TCAGA的启动子效率较CCAGA高75%,CCAGA比CTAGA低96.6%。分析THRSP基因的表达水平与不同启动子效率呈显著的相关性(P<0.05),并上瘦肉型猪群和脂肪型猪群这些SNP位点的基因频率分布规律一致。可见,THRSP因启动子区的A-95T、G-98A、A-376G、T-400C 和 C-459T位点是THRSP基因表达水平差异的关键调控者。
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