自然保护区生态补偿实践在我国出现的比较早,但到目前为止理论研究却一直滞后于实践的发展,随着科学发展观的贯彻,政府、公众对于生态价值、生态效益的理解日益深入,对自然保护区进行生态补偿的呼声也随之日益高涨。本文首先介绍了国内外有关生态价值和针对生态效益进行生态补偿的实践成果,引入环境和自然资源价值论、生态系统外部效益论、公共产品理论对进行生态补偿的必要性及基本技术路径进行了论述。接着介绍了研究区生态系统的重要性、当地社会经济水平的低下以及保护区的建设对当地居民的影响。然后,根据纳版河流域自然保护区生态系统的特点将其划分为三大生态系统,并且确定了主要生态服务功能类型,建立了符合本地区特点的生态价值评估指标体系和评估模型,对纳版河自然保护区的生态效益价值进行了评估。最后按照价值的实现形式可以将生态价值分为显性价值和潜在(隐性)价值,并且将显性价值分为可以通过市场实现和不可以通过市场实现两种。制定了通过以政府为主导,以市场推进的生态补偿机制,以实现研究区生态系统服务功能价值的基本框架。主要研究成果如下：1)纳版河流域国家级自然保护区的生态系统服务功能总价值为55106.03万元/a。其中,释放氧气为27528.32万元/a,水量调节价值为8050.57万元/a,固定二氧化碳价值为6624.43万元/a,水质净化价值为4853.26万元/a,滞尘价值为3795.32万元/a,固定土壤的价值为2131.00万元/a,保育物种的价值为1802.44万元/a,吸收大气污染物的价值为275.69万元/a。2)天然林和经济林和农用地的单位面积生态效益价值依次为：天然林31223.51元/ha·a、橡胶林11165.86元/ha·a、农用地2158.20元/ha·a。故从长远的社会、经济、生态效益来看,将天然林改种经济林(在版纳主要为橡胶林或者改为农用地)都是不明智的选择。3)在生态效益价值评估和综合前人研究成果的基础上,构建了针对纳版河流域自然保护区的生态补偿机制框架。目前,主要以政府为主导,同时加以市场推进,时辅以其他手段。政府在制定各种政策法规、制定管理办法、培育市场的同时,也必须进行大规模的生态补偿。目前市场相对成熟的一些生态效益,可以争取通过市场的手段进行生态补偿。一方面,市场机制进行调节,具有更大的优越性；另一方面,也可以减轻国家的财政负担。4)通过政府实现的公共财政途径中,可以灵活采用技术补偿、政策补偿、实物补偿和资金补偿多种手段,变“输血型”补偿为“造血型”补偿。在市场补偿途径中,目前主要是争取将固碳价值、涵养水源价值和维护生物多样性价值尽快推向国际的碳汇市场、水文市场及生物多样性市场,也可以尝试着在国内寻找买家。5)在补偿标准的确定中,通过政府实现的补偿为3308.68元/a;通过市场实现的补偿为16477.47元/a,其中水文市场8050.57元/a。、碳汇市场6624.43元/a。、生物多样性市场1802.44元/a。