目前,我国对高速公路绿化项目采用的都是事后的决算审计。在这种审计模式下,通常不能有效解决工程项目中存在的资源浪费、管理不善、效率效益不高等问题,无法对事前、事中、事后的全方位进行有效把控。因此,跟踪审计作为一种新型的审计模式应运而生。跟踪审计能贯穿于工程建设项目的全程,涵盖了工程项目的各个阶段,加强了工程项目审计的效率和效果。本文先从理论角度分析和阐述了项目审计的内涵及其分类,表明决算审计和跟踪审计是现阶段国内常采用的两种工程项目审计模式。通过阐述委托代理理论和利益相关者理论,为工程项目审计的案例研究提供一定的理论基础。其次,以MJ高速公路YC段绿化工程项目为案例研究对象,介绍了MJ高速公路YC段绿化工程项目的基本情况,以及在决算审计模式下该绿化工程项目审计的实施情况和审计结果。进而说明事后的决算审计在MJ高速公路YC段绿化工程项目中所显示出来的一些问题,即存在概预算方面审计不及时、招投标审计不及时以及审计的原始资料取证困难、隐蔽工程的审计方法难以把控的问题,在此基础上对MJ高速公路YC段绿化工程项目决算审计下存在问题的原因进行了剖析,得出存在这些问题是由于决算审计的观念还局限于合规性审计、对前期阶段的审计缺乏时效性以及审计力量严重不足,审计质量有待提高。再次,正因传统审计模式存在如此多的问题,本文提出要对MJ高速公路YC段绿化工程项目审计提出优化方案,即针对该绿化项目的投资立项阶段、勘察设计阶段、招投标阶段、工程施工阶段和竣工验收这五个阶段运用跟踪审计来进行优化。为了该绿化工程项目能更好的实行跟踪审计,审计部门应从准确把握项目审计的关键环节和介入深度、借助外部审计力量来提高审计质量等五个方面来保障跟踪审计能顺利有效的实施。