【摘 要】
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目的 在已获得的Graves病差异低表达基因片段(EST:CF569048)的基础上应用SMARTTM RACE技术获得其全长cDNA序列(TGDRF12)。 方法 在我们前期运用抑制消减杂交技术(SSH)获得Graves
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目的 在已获得的Graves病差异低表达基因片段(EST:CF569048)的基础上应用SMARTTM RACE技术获得其全长cDNA序列(TGDRF12)。 方法 在我们前期运用抑制消减杂交技术(SSH)获得Graves病差异低表达基因片段(EST:CF569048)的基础上,对EST进行生物信息学分析,并应用SMARTTM RACE技术分别获得Graves病差异表达基因的5’端和3’端,将测序结果去除载体后拼接成全长cDNA序列。将获得的全长序列到相关站点分析其阅读框架、进行同源性比较和相关的生物学功能分析。并应用Multiple Tissue Northern Blot检验其在正常人多种组织的表达。将获取的新序列利用Sequin程序进行登录到Genbank。 结果 应用SMARTTM RACE技术成功获得Graves病差异低表达基因的一条全长cDNA序列。此cDNA全长1620bp,开放阅读框架318bp,5’非编码区序列78bp,3’非编码区序列1224bp,共编码106个氨基酸。Multiple Tissue Northern Blot检验其在正常人3种组织(胃、甲状腺、肾上腺)中有较高表达,其中甲状腺最高,且都只有一个转录本(1.6kb),显示大小为1.6Kb左右。同源性分析表明其与蛋白质精氨酸甲基转移酶家族成员有很高的同源性。我们利用Sequin程序进行登录,被GenBank收录于Nr数据库中(accession number:AY786414),见附录四。 结论 通过应用sMARTTM RACE技术成功获得Graves病差异低表达基因的一条全长cDNA序列;Multiple Tissue Northern Blot检验其在正常人3种组织(胃、甲状腺、肾上腺)中有较高表达,其中甲状腺中最高,且都只有一个转录本,显示大小为1.6Kb左右;同源性分析表明其可能为精氨酸甲基转移酶家族中的一个新成员,可能在GD发病中起一定作用。
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