复合生态系统良性循环的基本要义是要处理好经济发展与人口、资源环境的关系，实现自然生态系统和社会经济系统良性循环的有机融合。本研究把生态系统的演进、生态经济的发展和循环经济新模式统一到复合生态系统良性循环的概念上认识，把良性循环发展作为科学发展观及“五个统筹”的理论基础，把提高系统物质、能量、信息流效率及循环度作为调控复合生态系统的着力点，并以福建省为例，以经济、社会和资源环境复合生态系统良性循环作为主线，以可持续发展战略、循环经济理论、生态经济学原理与系统工程方法为指导，采取自然科学研究与社会科学研究相结合、理论研究与决策建议研究相结合、定性研究与定量综合集成的系统循环分析方法，探讨复合生态系统良性循环的理论构建与实际问题，从资源环境与生态的视角阐述科学发展观的基本要义。本文研究的主要内容包括五个方面：(1)阐述了生态学、生态系统和生态经济理论的基本脉络，提出了经济、社会、资源环境复合生态系统理论的基本框架；(2)利用系统循环分析方法对福建省域复合生态系统特点进行了研究；(3)界定复合生态系统良性循环的内涵与标志、衡量的指标体系，根据良性循环的定量评估指标开展了分地区研究并进行地域分类分级；(4)提出复合生态系统的信息图谱设计及应用的思路与建议；(5)联系福建实际，研究提出了实现复合生态系统良性循环的对策措施与政策建议。