中小企业环境污染的治理问题一直困扰着各级政府,近年来各级政府出台了一系列政策来治理中小企业环境污染问题,但是政策实施效果并不理想。目前国内中小企环境治理政策研究以定性研究为主,通过建立模型进行仿真分析的研究较少。本文以博弈理论为基础,建立了三方博弈模型,博弈结果表明不存在现纯策略的均衡条件,纯策略无法形成自然博弈均衡点。通过混合策略均衡分析建立了三方博弈的复制动态方程,基于复制动态方程建立了SD模型并利用仿真软件进行仿真,发现也无法找到稳定的均衡点。由于中小企业环境污染治理政策博弈系统中三方演化博弈模型在原有的静态奖惩措施下无法得到稳定的系统均衡点,故采取动态奖惩措施。通过动态奖惩措施重新建立复制动态方程,以此建立SD模型并利用仿真软件进行仿真,发现系统能达到稳定的博弈均衡点,让各方达到博弈均衡状态。通过参数调控后的系统动力学模型仿真情况的变动分析,可以发现通过调整政策的不同方向可以影响中小企业污染完全整治的概率以及系统达到均衡的时间。政府可以在制定政策的时候,可以通过提高对中小企业完全整治的奖励力度、提高对企业的不完全整治惩罚力度、提高企业对居民补偿的金额这几方面有更加多的政策倾向,这样可以提高企业整改效率,也能提高居民的监督举报效果,更快更好的完成政策目标。