肯尼亚两种吊兰属(天门冬科)植物叶绿体基因组解析、比较和系统发育分析

来源 :中国科学院大学(中国科学院武汉植物园) | 被引量 : 0次 | 上传用户:haiyang1979
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
吊兰属(Chlorophytum Ker-Gawl.)隶属天门冬科(Asparagaceae),该属主要分布于非洲和亚洲的热带地区,少数见于南美洲和澳大利亚。非洲作为吊兰属植物物种起源和分化的中心,一直备受关注。肯尼亚位于非洲东部热带地区,具有东非最丰富的植物资源,拥有许多特有的吊兰属植物。吊兰属易与近缘属Dasystachys等混淆,且存在复合类群,部分物种的分类存在争议,并可能存在隐藏的物种多样性。吊兰属植物在非洲作为传统的药用植物外,还具有重要的观赏价值和生态修复功能。然而,到目前为止,关于该属的叶绿体基因组序列数据报道甚少,现仅有Chlorophytum rhizopendulum的叶绿体基因组数据,由于数据有限,没有提供足够的信息,从而导致关于该属的分子系统发育研究也非常有限。在本研究中,拼装了2种采自肯尼亚的吊兰属植物Chlorophytum comosum和C.gallabatense的叶绿体基因组序列,其长度分别为154,248 bp和154,154 bp。他们都具有典型的四分体结构,由大拷贝区(LSC)、小拷贝区(SSC)和一对分离的反向重复区域(IRa和IRb)序列组成。其中,C.comosum的 SSC 为18,016 bp,LSC 为 84,004 bp,IR 为 26,1 14 bp;C.gallabatense的SSC 为17,960 bp,LSC为83,686 bp,IR为26,254 bp。每个叶绿体基因组中有1 12个不同的基因,由78个蛋白质编码基因,30个tRNA编码基因和4个rRNA编码基因组成。与天门冬科其他属的5种植物的叶绿体基因组进行比较分析显示:他们在结构组织、基因含量和排列上,序列相似性普遍较高。另外,系统发育分析证实了前人的结论,并产生了具有相似拓扑的系统发育树。结果表明,吊兰属植物Chlorophytum comosum,C gallabatense和C.rhizopendulum在同一进化枝中聚集在一起,并与Anthericum ramosum的分支互为姊妹群,显示了它们之间非常密切的亲缘关系。本研究为对吊兰属进行进一步的分子进化和系统发育研究提供了有价值的信息,有助于填补基因组数据资源的空白,并为解决该属的系统分类学复杂等问题打下基础。
其他文献
钢筋锈蚀是导致混凝土结构耐久性问题的主要原因,对钢筋锈蚀的正确检测是评价混凝土结构剩余寿命和维修最重要的依据。本文在综述钢筋锈蚀原因、起锈检测方法及锈蚀速率表征
锆钛酸铅(Pb(Zr,Ti)O3)铁电薄膜材料由于具有优异的铁电和介电性能,使得该材料在非易失性存储器、太阳能电池和高能量密度电容器等应用领域十分广泛。由于该材料主要是通过铁电极
在我国粉煤灰库存量大、年增长速度高,大量的粉煤灰很少得到充分利用,不仅对环境造成了污染,还是对资源的一种浪费。粉煤灰具有火山灰活性,但在常温常压下化学稳定性依然较好
当今空调技术一方面为人们带来了舒适的环境,另一方面消耗了大量能源,造成了严重的环境负面影响。如何降低建筑能源消耗成为当前节能工作的重要内容之一。被动式降温技术是指
棉纤维是从胚珠表皮细胞分化而来的单细胞结构,其发育是一个由大量基因参与调控的复杂而有序的过程。超长链脂肪酸(VLCFAs)生物合成具有显著促进棉纤维发育的作用。β-酮脂酰
近些年来,在电子产品的电源选择中,锂电池相比于其他种类电池优势更加明显,应用也更加广泛。但是,锂电池在实际应用过程中可能会出现充电电压过度,放电电压过度,放电电流过大
航标是一种重要的助航设备,对船舶起着助航、引航和导航的作用,通过对航道方向、边界以及障碍物的标示,为水上交通运输提供一条安全、畅通、可靠的通道。内河航道水下河床地
近年来电动汽车发展如火如荼,成为未来新能源汽车主要力量。但是在电池续航能力仍然有待提高,人们采取了许多措施来提高电动汽车续航能力,诸如可更换电池、充电桩等。而磁耦
钢结构材料发展过程中,冷弯薄壁型钢作为一种具有多种优点的轻型钢材,相较于厚壁钢材用钢量少、价格便宜、并且具备足够的强度和稳定性,被大量应用于各种工业建筑和民用房屋
地聚合物材料因其优良的力学性能和制备过程中较低二氧化碳排放量,在建筑工程中的应用越来越广泛。然而,这类材料在恶劣环境下的工作能力还有待研究确认。本试验研究了不同配