随着经济迅速发展,我国对于民生越来越重视,而作为民生基础的医疗制度也在不断的改进。改革开放后,我国将卫生医疗事业推向了市场,政府不在具有主导地位,但随着医疗改革的不断推进,市场化的医疗体系使医药费用变的越来越高,让中国对医疗改革开始重新反思。2009年是我国医疗改革的新起点,对其发展道路进行了新一轮的规划,使医院更好的服务于群众,发挥自身的公益性。2015年,国务院发布了《深化医药卫生体制改革2015年重点工作任务》,要求破除以药补医的现象,合理理顺医院服务价格。在新医疗改革的大背景下,本文将公立医院作为研究对象,结合医疗改革的要求,对院的内部控制制度展开研究。通过分析医院内部管理存在的问题,寻求建立一套适用于公立医院体制内部控制制度,旨在使公立医院拥有一个良好的经营管理环提供保证。本文选取了医疗改革试点医院,内蒙古B公立医院作为案例,考虑到B医院是非盈利组织事业单位的特殊性质,选择以《行政事业单位内部控制规范》(《内控规范》)作为为B公立医院设计内部控制体系的理论基础,建立一套具有公立医院特的内部控制制度。我国目前多集中于企业的内部控制度研究,应用最广泛的是内部控制五要素。对于公立医院的内部控制研究大多也是融合了企业内部控制和COSO作为理论基础的,并没有针对公立医院独特的经营模式来进行研究。本文首先由宏观角度出发,从医疗改革的总体目标以及对医院会计制度的要求为出发点,分析了新医改对公立医院内部控制的要求。其次以试点医院内蒙古B医院作为具体研究对象,并结合《内控规范》,从单位层面和业务层面两个角度深入分析了B医院在内部控制方面存在的问题,最终结合新医改的要求,分别从上述两方面对案例医院的内部控制进行了设计。研究表明,就目前我国的公立医院而言,还没有建立起完善的内部控制体系,并且也并不重视内部控制制度。因而,发展公立医院内部控制制度变成了一件迫在眉睫的事。希望通过对B医院内部控制的研究,帮助改医院改善内部经营环境,提高经济效益和社会效益,从而对我国其他公立医院的内部控制制度起到启示、建议的作用。推动我国医疗改革的进程,帮助医院建立完善的内部控制体系,改善其管理环境,提高服务质量,更好的为群众服务。