烟草镰孢菌根腐病是福建省烟区为害较为严重的烟草根茎病害,选种抗病品种是防治镰孢菌根腐病经济有效的方法。为建立烟草抗镰孢菌根腐病品种筛选鉴定体系,分离和鉴定了该病的病原物并利用病原菌及粗毒素作为筛选压分别进行抗病性的鉴定及相关性分析,通过田间试验验证两种筛选抗病品种方法的可行性,主要研究结果如下:1.首次报道Fusarium commune为烟草根腐病致病菌:2015-2016年从福建省三明市主要烟区采集的烟草根腐病病样中分离获得31个镰孢菌属菌株（F1～F31）。对所分离的菌株进行形态学甄别、系统进化分析、种特异分子鉴定及致病性测定,结果表明:分离菌株显微形态特征与尖孢镰孢（Fusarium oxysporum）和共享镰孢（F.commune）相似;采用贝叶斯法（Bayesian Analysis）对4株分离菌F-04、F-18、F-19和F-28的rDNA基因内间隔区（IGS）基因作系统发育分析,结果显示这4个菌株同F.commune聚为一类并与F.oxysporum明确区分;种特异性分子鉴定结果表明分离所有菌株均为F.commune。通过室内接种试验验证了分离菌株F.commune的致病性,明确其为烟草根腐病的主要病原物,这是我国首次报道共享镰孢（F.commune）引起烟草根腐病。2.初步鉴定5种烟草品种对病原菌的抗病性:采用病原真菌伤根接种法对福建省主要栽培烟草品种CB-1、K326、云烟87和其他品种TN90、B08-4进行品种抗病性鉴定。结果表明:引起烟草根腐病的4株病原菌（F.commune）F-04、F-18、F-19、F-28间存在致病性分化。烟草对病原菌的抗性上也存在差异,品种间抗性能力鉴定为B08-4>CB-1>TN90>K326>云烟87。3.明确烟草品种抗病原菌粗毒素和抗病原菌致病的能力成正相关关系,利用粗毒素筛选法对供试的36个烟草品种进行了抗性分级:采用控制单因素变量的方法,利用烟草根腐病致病菌培养获得的粗毒素作为品种抗病性的筛选压,通过观察粗毒素对烟草毒害程度来评定烟草抗病性。结果表明:不同菌株之间产毒能力存在一定的差异,F-19产毒量较高且产毒能力与病原菌致病力不存在相关性;粗毒素对烟苗有致病性,毒素处理后烟苗症状与病原菌侵染症状相似;粗毒素最适处理时间为5 d,最优处理浓度为60～80 mg/L;烟草各品种间对毒素的抗性有明显的差异,品种内株系间对毒素的抗性存在一定的分化。烟草抗毒素能力与抗病原菌能力为正相关关系,相关系数为0.849。在一定条件下粗毒素筛选法是可代替病原菌直接接种法用于鉴定烟草抗根腐病筛选方法,采用此方法,对36个烟草品种进行抗病等级的评价。4.室内抗性与田间抗性鉴定结果存在一定差异,烟草具有阶段性抗病性特点:利用重病烟田结合人工接种病原菌作病圃进行烟草品种田间抗病性鉴定试验,结果表明:烟草不同生长阶段品种的抗性出现分化,影响田间烟草品种发病的因素复杂多变,具有阶段性抗性特点。田间抗性鉴定结果为,岩烟97>K326>革新三号>翠碧一号>云烟87>B08-4,这一结果与室内评定的品种抗性结果存在差异。