樱桃病毒感染在现阶段樱桃生产中普遍存在,其主要通过嫁接相互传播,造成树势衰弱,降低果实产量和品质。明确樱桃病毒原种类,对于建立樱桃病毒检测体系及樱桃植株无病毒化技术,获得具有优良性状的甜樱桃品种和砧木的无病毒原种以及樱桃病毒病的防控具有重要的理论意义和应用价值。为了明确北京地区现有樱桃种质资源中的病毒原种类,从海淀区北京市林业果树科学研究院樱桃资源圃以及通州区樱桃基地共采集100棵砧木盆栽苗、24棵采穗圃砧木、94棵甜樱桃品种的样品,通过RT-PCR和小RNA测序的方法进行樱桃病毒原的检测鉴定。结果在被检测樱桃种质资源中共发现了9种病毒和1种类病毒。包括李矮缩病毒(Prunus dwarf virus,PDV)、李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ring spot virus,PNRSV)、樱桃绿环斑驳病毒(Cherry green ring mottle virus,CGRMV)、樱桃坏死锈斑驳病毒(Cherry necrotic rusty mottle virus,CNRMV)、樱桃病毒A(Cherry virus A,CVA)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、李树皮坏死茎痘伴随病毒(Plum bark necrosis stem pitting-associated virus,PBNSPaV)、樱桃小果病毒-1 (ittle cherry virus-1,LChV-1)以及啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd)。RT-PCR检测以上病毒均获得特异性条带,测序后比对,序列正确。此外,在3棵甜樱桃品种上发现樱桃扭叶伴随病毒(Cherry twisted leaf associated virus,CTLaV),设计特异性鉴定引物(F:5′-TCAGCAAGATTAAGGAGGTTG-3′,R:5′-ATNGGTTGAATTTGGCCAGT-3′)进行RT-PCR检测,检测结果显示特异的CTLaV条带,测序验证无误。CTLaV在国内尚未报道,下一步计划获得其全序列进行进一步分析。