基于16S-23S核糖体DNA内转录间隔区间(ITS)和其他基因区间PCR引物比对,获得PCR引物用以鉴别PSA(猕猴桃溃疡病)不同菌株

来源 :中国园艺学会猕猴桃分会第四届研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dumala
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目前报道的已有几个用于鉴定PSA(Pseudomonas syringae pv.actinidiae)的PCR引物,该病菌引起猕猴桃的溃疡病,但发现这几个引物缺乏专一性.两组新的PCR引物,PsaF1/R2和PsaF3/R4,已设计出来,并且与16S-23S核糖体DNA内转录间隔区间(ITS)有区域互补性.这些引物由一个PSA菌株的DNA片段扩增而来,而并不是来自6个属、17种植物上获得的56个溃疡病菌株,仅有一例菌株来自茶树病菌(P.syringae pv.theae,PST).当用这些引物去检测由另外20个采自日本、韩国、意大利和美国不同菌株培养物提取的DNA时,除6个培养物外,其余的都得到了期望的片段,用PsaF1/R2引物扩增出280 bp片段,PsaF3/R4引物获得175 bp片段.当用5个看家基因(gyrB,acnB,rpoD,pgi和cts)进行多基因序列分析后发现这6个菌株在系统发育地位上就不是PSA类型.与PSA典型菌株相反的是,这6个菌株在冰核化和丁香假单胞菌素进行的鉴定测试中,都呈现阳性.由此结果也可以推断出这6个菌株是被错误地鉴定为PSA了.利用ITS,gyrB,acnB,rpoD,pgi和cts基因区域设计的PCR引物还不能将PSA与其系统发育很近似的茶树溃疡病菌(PST)区分开来,由于PST不太可能在猕猴桃上出现,引物对PsaF1/R2和PsaF3/R4可以用于筛选猕猴桃树体组织内的PSA菌株.
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