鸡源奇异变形杆菌中新型多重耐药杂合型IncC质粒的全序列分析

来源 :第五届全国禽病分子生物技术青年工作者会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:luhy1123
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  奇异变形杆菌是规模化鸡场重要的条件致病菌,严重威胁食品安全和公共健康.鸡场抗生素的广泛使用,鸡源奇异变形杆菌多重耐药性日趋严重.不相容组C( IncC)质粒是革兰氏阴性菌中最早发现的与介导多重耐药相关的质粒之一,常携带头孢菌素酶基因blaCMY-2和碳青霉烯酶基因blaNDM,介导三代头孢菌素和碳青霉烯类耐药.根据质粒骨架区核苷酸序列的差异,IncC质粒常被分为1型和2型.目前,奇异变形杆菌中IncC质粒的基因组序列未见报道.研究采用Illumina HiSeq平台对鸡源奇异变形杆菌来源的IncC质粒(pPm14C18)进行高通量测序,采用SimPlot v3.5.1和MEGA6.0分析pPm14C18的同源重组和遗传进化.测序结果表明,pPm14C18全长序列为165992 bp,包含165个ORFs,GenBank登录号为KU605240,携带了15个抗生素耐药基因、2个消毒剂类耐药基因和1个重金属(汞)耐药基因簇.pPm14C18骨架区G+C含量为51.2%,同源重组分析表明其为新型杂合型IncC质粒,由1型和2型IncC质粒同源重组产生.pPm14C18携带了一个由TnAs3转座子组成的多重耐药区ARI-A,内部包含多个耐药基因,由IS26介导的转座和整合子可变区的交换形成.52个IncC质粒骨架区ML建树结果显示pPm14C18位于1型和2型IncC质粒之间,阐明了IncC质粒的系统发育关系.IncC质粒常介导病原菌产生多重耐药表型,给兽医临床治疗带来困难,需加强对规模化鸡场病原菌中多重耐药IncC质粒的监测.
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